53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1407 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  99.1 
 
 
442 aa  902    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  78.68 
 
 
441 aa  727    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  100 
 
 
442 aa  907    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  59.28 
 
 
429 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  55.86 
 
 
431 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  51.47 
 
 
431 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  44.34 
 
 
435 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  44.34 
 
 
435 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  45.05 
 
 
433 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  39.73 
 
 
430 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  38.13 
 
 
430 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  35.7 
 
 
446 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  30.69 
 
 
440 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  24.83 
 
 
629 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  27.76 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  25.28 
 
 
618 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  28.31 
 
 
560 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  21.99 
 
 
578 aa  66.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  26.4 
 
 
823 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  22.41 
 
 
626 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  25.48 
 
 
822 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  25.3 
 
 
821 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 
826 aa  60.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  23.42 
 
 
833 aa  60.1  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  29.75 
 
 
673 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  23.08 
 
 
616 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  25.3 
 
 
891 aa  57.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  24.64 
 
 
825 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  23.19 
 
 
841 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  23.74 
 
 
841 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  26.3 
 
 
570 aa  55.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  27.74 
 
 
676 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
822 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  23.84 
 
 
608 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  23.06 
 
 
758 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  23.23 
 
 
820 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  22.56 
 
 
577 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  23.08 
 
 
824 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  23.55 
 
 
812 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  23.84 
 
 
623 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  26.04 
 
 
589 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  25.29 
 
 
645 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  48.15 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  27.5 
 
 
671 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  23.74 
 
 
578 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  23.98 
 
 
507 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  30 
 
 
632 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  26.92 
 
 
647 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  22.5 
 
 
648 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  24.12 
 
 
629 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  29.37 
 
 
239 aa  43.5  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 
826 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 
826 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>