More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1367 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1367  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.780274  hitchhiker  0.00766256 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3154  LysR family transcriptional regulator  99.33 
 
 		 297 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  97.64 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  97.31 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2658  LysR family transcriptional regulator  87.88 
 
 		 297 aa  524  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1223  LysR family transcriptional regulator  86.87 
 
 		 320 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  86.53 
 
 		 297 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1222  LysR family transcriptional regulator  85.86 
 
 		 297 aa  517  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.907683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1293  LysR family transcriptional regulator  85.86 
 
 		 297 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3537  LysR family transcriptional regulator  55.89 
 
 		 306 aa  333  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0207  transcriptional regulator, LysR family protein  52.54 
 
 		 297 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1675  LysR family transcriptional regulator  55.59 
 
 		 300 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1388  LysR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 297 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.837907  normal  0.0605197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2566  transcriptional regulator, LysR family protein  50.51 
 
 		 297 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.169801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1769  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 300 aa  244  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0552  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 303 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.268778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0852  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0564501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1835  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6122  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5712  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  42.65 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7036  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753996  normal  0.202987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1459  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6369  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2580  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.64734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4973  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00010332  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00136  transcriptional regulator  42.51 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0939848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5812  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394289  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0901  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273357  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5596  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2209  transcriptional regulator transcription regulator protein  40.77 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852985  normal  0.255336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5474  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.361907  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4888  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842782  hitchhiker  0.000000597964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2407  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4371  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120427  normal  0.0114569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2013  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.706751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6436  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 320 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01918  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.89 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.577058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01904  hypothetical protein  37.89 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.444507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3247  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  35.76 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2949  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666822  hitchhiker  0.000000000477709 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7006  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1044  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2153  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1489  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5569  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21388  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5934  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6340  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1217  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1625  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.27656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2306  LysR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1642  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0837368  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1739  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2629  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0897024  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4168  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0180003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4099  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3009  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3695  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1432  transcriptional regulator, MarR family  36.55 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3250  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2294  LysR substrate binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0349652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2247  LysR substrate binding domain protein  36.14 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160886  normal  0.244849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2193  LysR substrate binding domain protein  36.14 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.453125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2406  LysR substrate binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2296  LysR substrate binding domain protein  35.79 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4267  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287329  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2472  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.1 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000020853  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2013  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000422246  normal  0.025363 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4110  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180794 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3997  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0518  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0736  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.54796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2000  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000154279  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3521  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81702  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1175  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 304 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2112  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.4 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000406165  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0518  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2312  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0007989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.75 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0501585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1970  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.28 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1856  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.28 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000498178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1981  transcriptional regulator, LysR family  34.28 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0211001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2167  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000280359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2202  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000614587  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1539  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.28 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0989364  normal  0.0522368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2371  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.28 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000154931  normal  0.139857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1872  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.28 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000144024  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2204  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01630  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.28 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1739  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.28 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  9.075529999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01619  hypothetical protein  34.28 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2137  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.4 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543742  normal  0.0202004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3395  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2002  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.2 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0975568  hitchhiker  0.000333311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2061  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.2 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159337  hitchhiker  0.000037985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00415  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.75 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1805  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.21 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>