20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1354 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1354  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  unclonable  0.00000000000154213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3167  hypothetical protein  89.05 
 
 
210 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0454654  hitchhiker  0.000351492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3009  hypothetical protein  85.65 
 
 
216 aa  350  7e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3024  hypothetical protein  89.05 
 
 
210 aa  350  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1210  hypothetical protein  71.51 
 
 
179 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1280  hypothetical protein  88.06 
 
 
179 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1209  hypothetical protein  87.31 
 
 
179 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0691759  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3336  hypothetical protein  73.03 
 
 
190 aa  249  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1292  hypothetical protein  61.99 
 
 
161 aa  214  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1104  hypothetical protein  58.27 
 
 
201 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1278  hypothetical protein  62.7 
 
 
157 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2378  hypothetical protein  56.35 
 
 
156 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1530  hypothetical protein  61.59 
 
 
162 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0510637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1417  hypothetical protein  59.23 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.737063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1248  hypothetical protein  56.82 
 
 
198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.935468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0903  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04076  hypothetical protein  45 
 
 
148 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04740  hypothetical protein  34.5 
 
 
180 aa  98.2  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0938  hypothetical protein  31.11 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1338  hypothetical protein  35.56 
 
 
162 aa  85.5  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.923186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>