More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1332 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  90.62 
 
 
385 aa  732  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  93.23 
 
 
385 aa  753  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  84.66 
 
 
379 aa  686  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  79.58 
 
 
379 aa  639  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
388 aa  812  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  5.75717e-05  hitchhiker  9.04617e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3031  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  98.45 
 
 
388 aa  803  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  98.97 
 
 
388 aa  806  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.24324e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  78.51 
 
 
378 aa  644  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1121  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  78.99 
 
 
378 aa  643  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.002803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  92.71 
 
 
385 aa  749  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  92.97 
 
 
385 aa  751  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  77.98 
 
 
378 aa  637  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.26864e-05  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  92.57 
 
 
387 aa  740  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2687  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  76.83 
 
 
400 aa  639  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000667437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3189  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  98.97 
 
 
388 aa  805  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000939892  normal  0.198948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2483  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  79.89 
 
 
379 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274904  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  60.9 
 
 
379 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  60.37 
 
 
378 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  60.64 
 
 
379 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  60.73 
 
 
391 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  60.27 
 
 
380 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  59.95 
 
 
390 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  60.21 
 
 
392 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  60.64 
 
 
379 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  59.31 
 
 
378 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  58.78 
 
 
378 aa  469  1e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  59.04 
 
 
378 aa  469  1e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  58.78 
 
 
378 aa  469  1e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  59.04 
 
 
378 aa  469  1e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  58.51 
 
 
376 aa  466  1e-130  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  58.51 
 
 
376 aa  466  1e-130  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  58.51 
 
 
376 aa  466  1e-130  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  58.78 
 
 
378 aa  468  1e-130  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  59.04 
 
 
378 aa  466  1e-130  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  58.78 
 
 
378 aa  468  1e-130  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  59.63 
 
 
380 aa  466  1e-130  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  58.58 
 
 
386 aa  466  1e-130  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  58.51 
 
 
378 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  58.93 
 
 
378 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  58.93 
 
 
378 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  58.93 
 
 
378 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  58.93 
 
 
378 aa  461  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  58.67 
 
 
378 aa  458  1e-128  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.03 
 
 
380 aa  455  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  53.71 
 
 
392 aa  451  1e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  57.18 
 
 
396 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3668  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.57 
 
 
388 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.231493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  54.74 
 
 
401 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  54.69 
 
 
384 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  54.17 
 
 
384 aa  416  1e-115  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  54.4 
 
 
391 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  53.26 
 
 
386 aa  407  1e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  54.13 
 
 
391 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  54.67 
 
 
395 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  54.4 
 
 
391 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  52.49 
 
 
408 aa  399  1e-110  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  56 
 
 
404 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  55.47 
 
 
404 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.87 
 
 
387 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  51.85 
 
 
385 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  49.74 
 
 
404 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  49.74 
 
 
404 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  50 
 
 
404 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  49.74 
 
 
404 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  49.47 
 
 
404 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  48.65 
 
 
375 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0855  coproporphyrinogen III oxidase  49.47 
 
 
404 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0665  coproporphyrinogen III oxidase  48.94 
 
 
404 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0912478  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  49.47 
 
 
404 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.27 
 
 
382 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  49.34 
 
 
405 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  50.26 
 
 
383 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  52.42 
 
 
373 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3308  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  51.86 
 
 
390 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0901  coproporphyrinogen III oxidase  48.94 
 
 
409 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482511  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.65 
 
 
375 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  49.08 
 
 
405 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  49.08 
 
 
405 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  49.08 
 
 
405 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  49.08 
 
 
405 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  49.08 
 
 
405 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  49.08 
 
 
405 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  49.74 
 
 
383 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2276  hypothetical protein  48.53 
 
 
375 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2322  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.21 
 
 
388 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2303  hypothetical protein  48.79 
 
 
375 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03095  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  53.85 
 
 
341 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.453176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  49.47 
 
 
380 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.68 
 
 
396 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  48.28 
 
 
405 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3089  coproporphyrinogen III oxidase  47.62 
 
 
409 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610477  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.66 
 
 
400 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.42 
 
 
394 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  46.51 
 
 
399 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.92 
 
 
389 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.75 
 
 
416 aa  362  5e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.32 
 
 
385 aa  362  9e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.88 
 
 
419 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.37 
 
 
414 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  48.42 
 
 
422 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>