280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1258 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  90 
 
 
370 aa  647  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  90 
 
 
370 aa  647  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  89.73 
 
 
370 aa  647  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.09785e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  99.46 
 
 
370 aa  741  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.10304e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  99.46 
 
 
370 aa  743  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.53775e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
370 aa  744  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.6572e-06  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  89.43 
 
 
370 aa  654  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  90 
 
 
370 aa  645  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
370 aa  744  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.74217e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  78.65 
 
 
370 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.71858e-07  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  78.05 
 
 
371 aa  614  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.66343e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  78.32 
 
 
369 aa  612  1e-174  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  76.49 
 
 
370 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  76.76 
 
 
370 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  76.49 
 
 
370 aa  572  1e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  5.06114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  77.57 
 
 
370 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  49.17 
 
 
368 aa  349  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  51.38 
 
 
388 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  47.96 
 
 
366 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  41.67 
 
 
370 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  39.57 
 
 
366 aa  295  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  1.55201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  37.67 
 
 
366 aa  284  1e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  39.3 
 
 
366 aa  284  1e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.32404e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  38.06 
 
 
358 aa  269  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  38.51 
 
 
367 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  39.3 
 
 
371 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  36.93 
 
 
375 aa  244  2e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  39 
 
 
383 aa  243  4e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  36.83 
 
 
375 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  40.06 
 
 
373 aa  242  8e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  38.71 
 
 
371 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  38.42 
 
 
371 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  37.53 
 
 
372 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  39.1 
 
 
370 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  38.94 
 
 
371 aa  234  2e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  37.82 
 
 
386 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  39.18 
 
 
372 aa  220  2e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  37.27 
 
 
372 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  36.96 
 
 
364 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  9.83322e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  36.96 
 
 
364 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.32318e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  36.96 
 
 
364 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.28546e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  36.09 
 
 
367 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  30.36 
 
 
359 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  36.55 
 
 
376 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  30.36 
 
 
359 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  36.72 
 
 
372 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  4.18027e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  35.25 
 
 
366 aa  195  8e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  9.98605e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  35.25 
 
 
366 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.20962e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  35.41 
 
 
366 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  35.25 
 
 
366 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.94674e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  35.68 
 
 
366 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  9.73807e-05  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  35.68 
 
 
366 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.34787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  35.25 
 
 
366 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  2.67736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  35.25 
 
 
366 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.134e-09  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  35.68 
 
 
366 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  35.68 
 
 
366 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.85303e-05  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  35.25 
 
 
366 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.24635e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  35.68 
 
 
366 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  35.25 
 
 
366 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  2.45131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  37.74 
 
 
364 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  2.98554e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  32.16 
 
 
360 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3556  permease YjgP/YjgQ family protein  38.1 
 
 
366 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3719  permease YjgP/YjgQ family protein  36.49 
 
 
370 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  32.35 
 
 
381 aa  183  5e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  35.48 
 
 
372 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3736  permease YjgP/YjgQ family protein  34.54 
 
 
359 aa  182  8e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  31.18 
 
 
367 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  30.31 
 
 
369 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  29.86 
 
 
371 aa  166  7e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  31.74 
 
 
371 aa  166  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  29.77 
 
 
371 aa  165  1e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  30.42 
 
 
371 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  31.21 
 
 
339 aa  159  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  29.26 
 
 
361 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  29.56 
 
 
365 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  32.44 
 
 
386 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  29.01 
 
 
370 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  32.68 
 
 
372 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  28.73 
 
 
365 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  28.45 
 
 
364 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  28.73 
 
 
365 aa  154  3e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  28.73 
 
 
365 aa  154  3e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  28.73 
 
 
365 aa  154  3e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  28.73 
 
 
365 aa  154  3e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  28.73 
 
 
365 aa  154  3e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  28.73 
 
 
365 aa  154  3e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  27.62 
 
 
363 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  32.11 
 
 
372 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  34.13 
 
 
370 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  30.06 
 
 
372 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 
363 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  30.35 
 
 
373 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 
365 aa  147  4e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  28.73 
 
 
365 aa  146  4e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  31.81 
 
 
372 aa  145  7e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  28.13 
 
 
364 aa  145  8e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  28.13 
 
 
364 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  28.13 
 
 
364 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0875  hypothetical membrane spanning protein  33.23 
 
 
372 aa  141  2e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  26.25 
 
 
360 aa  141  2e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>