190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1202 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1202  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133475  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3169  hypothetical protein  99.24 
 
 
264 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000178583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3312  hypothetical protein  98.86 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000132852  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3168  hypothetical protein  98.48 
 
 
264 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000679304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3481  hypothetical protein  84.02 
 
 
264 aa  427  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  77.27 
 
 
264 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  75.57 
 
 
264 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  75.19 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  56.5 
 
 
262 aa  289  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1011  hypothetical protein  55.5 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  46.22 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
245 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  30.74 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  30.38 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
245 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
246 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.49 
 
 
251 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.45 
 
 
253 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  30.91 
 
 
243 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  28.51 
 
 
247 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3146  extracellular solute-binding protein family 3  28.91 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.69 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  27.83 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1423  putative polar amino acid transport system substrate-binding proetin  26.45 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0156729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  27.68 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1937  ABC transporter  28.26 
 
 
241 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.017487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2148  hypothetical protein  29.57 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.8287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0258  hypothetical protein  29.78 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1741  conserved hypothetical ABC transporter protein  28.45 
 
 
248 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497041  hitchhiker  0.00104039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2719  ABC transporter  28.45 
 
 
248 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2644  ABC transporter  28.45 
 
 
248 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00601  probable ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.56 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2605  ABC transporter  27.69 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0719  hypothetical protein  30.72 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507397  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2355  ABC transporter  30.04 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0184824  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0342  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.18 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.649622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5333  hypothetical protein  27.75 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2473  succinate dehydrogenase (ubiquinone)  32.79 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1879  ABC transporter  29.05 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4250  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.78 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  26.95 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4891  hypothetical protein  27.07 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2283  ABC transporter  30.39 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261619  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  26.67 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2682  ABC transporter  27.49 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.76928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4230  hypothetical protein  27.43 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1477  extracellular solute-binding protein family 3  25.66 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2954  hypothetical protein  24.86 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  26.7 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1574  ABC transporter  27.36 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00475707  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4742  hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177685  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3223  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding  23.44 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67850  putative ABC-type amino acid transport protein, periplasmic component  25.42 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.349677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  29.2 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1973  ABC transporter  30.81 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5873  hypothetical protein  25.42 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54230  hypothetical protein  22.71 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.638501  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4365  hypothetical protein  26.58 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  26.75 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0328  hypothetical protein  24.7 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  26.1 
 
 
248 aa  62.4  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.71 
 
 
264 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  23.53 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3879  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.1 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4158  extracellular solute-binding protein family 3  26.16 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1683  hypothetical protein  26.75 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  25.62 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0921  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0802  hypothetical protein  27.85 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1009  hypothetical protein  24.57 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.815562  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.16 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4249  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2873  hypothetical protein  26.05 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0466901  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4251  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.71 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0440  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  26.11 
 
 
481 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0969  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4441  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.33 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  27.06 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>