63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0923 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  100 
 
 
267 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  97 
 
 
270 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  96.63 
 
 
269 aa  520  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  83.52 
 
 
262 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  82.4 
 
 
262 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  98.82 
 
 
173 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  46.52 
 
 
278 aa  222  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3437  hypothetical protein  96.7 
 
 
91 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  57.36 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  57.89 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  57.84 
 
 
171 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  46.03 
 
 
141 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  46.83 
 
 
151 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  50.49 
 
 
131 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  53.54 
 
 
149 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  53.54 
 
 
149 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  53.54 
 
 
149 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  53.54 
 
 
149 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  48.48 
 
 
137 aa  99  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  49 
 
 
138 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  47.47 
 
 
135 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  44.44 
 
 
148 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  44.44 
 
 
148 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  43.43 
 
 
147 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  32.04 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  34.65 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  37.07 
 
 
131 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  32.98 
 
 
154 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  28.42 
 
 
183 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  27.37 
 
 
183 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  35.35 
 
 
131 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  30.23 
 
 
203 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  34.04 
 
 
134 aa  52  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  37.5 
 
 
223 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  34.88 
 
 
131 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  32.98 
 
 
159 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  31.91 
 
 
157 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  34.88 
 
 
131 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  27.08 
 
 
196 aa  48.9  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.27 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  23.39 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.47 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  29.79 
 
 
133 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  24.81 
 
 
138 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  22.64 
 
 
122 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  30.09 
 
 
131 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 
113 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  31.63 
 
 
166 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  24.49 
 
 
199 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  26.85 
 
 
149 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  27.37 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  27.52 
 
 
123 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  29.7 
 
 
109 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  31.25 
 
 
210 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  31.25 
 
 
210 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  28.1 
 
 
139 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  28.72 
 
 
185 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  27.18 
 
 
157 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  30.21 
 
 
132 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>