74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0635 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  100 
 
 		 355 aa  721    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  98.87 
 
 		 355 aa  712    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  98.59 
 
 		 355 aa  711    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  99.15 
 
 		 355 aa  714    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0677  porin  79.15 
 
 		 350 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  50.97 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  47.66 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0238  porin  36.26 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4215  porin  38.53 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.489674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2545  porin  38.35 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2365  porin  34.17 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.132494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1360  porin  34.71 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.646468  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3663  porin  36 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0282  porin  36 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1259  porin  38.78 
 
 		 386 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042009 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  26.64 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3127  porin Gram-negative type  30.48 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.970335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  27.41 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2010  porin  29.78 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  25.21 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  25.69 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  27.37 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06287  hypothetical protein  24.73 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  25.35 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  26.87 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  26.15 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  24.45 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  23.54 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2182  outer membrane protein, porin  25.99 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  25.74 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  31.03 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  39.77 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  27.64 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0162  outer membrane protein OmpU  24.75 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  24.58 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  31.18 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  31.18 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  31.18 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  36.04 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  38 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  30.99 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  25.56 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  25 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  25.56 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  25.56 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  32.26 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  27.73 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3613  porin  23.88 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  30.66 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2781  hypothetical protein  37.14 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000711113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  25.16 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  32.35 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  26.64 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  24.79 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  28.05 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  24.21 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  25.32 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  28.96 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  24.73 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  24.84 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  29.94 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  27.23 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0301  porin  25.55 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0419349  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  23.08 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  26.14 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  27.88 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  27.4 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  24.24 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  27.4 
 
 		 314 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  27.4 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  28.51 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>