More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0515 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  100 
 
 
168 aa  333  6e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  72.94 
 
 
169 aa  236  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  69.62 
 
 
175 aa  196  1e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.46782e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  56.07 
 
 
173 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  49.42 
 
 
172 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.27612e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  53.8 
 
 
172 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  51.11 
 
 
172 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.12537e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  54.91 
 
 
173 aa  143  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  51.11 
 
 
176 aa  140  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.43336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  48.62 
 
 
174 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  5.13166e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  48.4 
 
 
182 aa  137  5e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  51.65 
 
 
163 aa  137  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  47.49 
 
 
169 aa  135  3e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  52.73 
 
 
173 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.58454e-05  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  47.49 
 
 
169 aa  132  2e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.94883e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  50 
 
 
166 aa  132  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  47.49 
 
 
171 aa  130  8e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  61.98 
 
 
186 aa  129  2e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.97616e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  46.45 
 
 
178 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.02365e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  45.65 
 
 
169 aa  126  1e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  48.57 
 
 
170 aa  124  8e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  45.76 
 
 
172 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  44.05 
 
 
165 aa  120  1e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  46.86 
 
 
169 aa  119  2e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  50.63 
 
 
159 aa  116  1e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  46.25 
 
 
169 aa  116  1e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.41512e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  62.07 
 
 
168 aa  112  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  70.15 
 
 
157 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  40.66 
 
 
156 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  37.35 
 
 
190 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  40.23 
 
 
166 aa  99  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  37.93 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  47.83 
 
 
151 aa  98.2  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  40 
 
 
146 aa  98.2  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  37.5 
 
 
163 aa  94.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  65.15 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  39.05 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  52.38 
 
 
163 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  34.46 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  42.37 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  34.46 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  57.81 
 
 
187 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  32.58 
 
 
179 aa  84  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  32.77 
 
 
164 aa  83.6  1e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  38.25 
 
 
176 aa  82  3e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  31.79 
 
 
170 aa  82  4e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  81.3  5e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  81.3  6e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  33.14 
 
 
167 aa  80.9  9e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  57.89 
 
 
174 aa  80.5  9e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  33.14 
 
 
167 aa  79.7  2e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  32.56 
 
 
167 aa  79.7  2e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  9.43511e-10 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  50.62 
 
 
186 aa  78.6  4e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  56.58 
 
 
174 aa  78.6  4e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  64.52 
 
 
172 aa  77.4  8e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  62.3 
 
 
172 aa  77.4  9e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  62.3 
 
 
172 aa  77.4  9e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  62.3 
 
 
172 aa  77.4  9e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  62.3 
 
 
172 aa  77.4  9e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  50 
 
 
163 aa  76.6  1e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  31.98 
 
 
167 aa  77  1e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0177  prepilin-type cleavage/methylation  35.08 
 
 
186 aa  74.7  6e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  45.54 
 
 
108 aa  74.3  8e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70582e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  46.51 
 
 
173 aa  73.9  1e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  29.94 
 
 
167 aa  73.9  1e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  46.51 
 
 
182 aa  72.8  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  31.1 
 
 
163 aa  73.2  2e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  50.85 
 
 
156 aa  70.1  1e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  40 
 
 
205 aa  70.1  1e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  37.89 
 
 
211 aa  69.7  2e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  39.53 
 
 
218 aa  68.9  3e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.24061e-08  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  38.82 
 
 
205 aa  68.9  3e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  38.82 
 
 
205 aa  68.6  4e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  7.95599e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  38.82 
 
 
205 aa  68.6  4e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  53.03 
 
 
182 aa  68.6  4e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  36.96 
 
 
201 aa  68.6  4e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  53.73 
 
 
193 aa  68.6  4e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  51.61 
 
 
169 aa  68.2  5e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  38.82 
 
 
205 aa  67.8  6e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.75672e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  38.82 
 
 
205 aa  67.8  6e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.6206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  38.82 
 
 
205 aa  67.8  6e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  38.82 
 
 
205 aa  67.8  6e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.65015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  54.41 
 
 
185 aa  67.8  7e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  54.93 
 
 
187 aa  67.4  8e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  35.87 
 
 
205 aa  67.4  9e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  8.85834e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  38.82 
 
 
205 aa  67.4  9e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  4.93749e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  42.22 
 
 
202 aa  66.6  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.62752e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  48.15 
 
 
136 aa  67  1e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  29.44 
 
 
197 aa  67.4  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  52.86 
 
 
187 aa  66.6  2e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  52.86 
 
 
187 aa  66.6  2e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  52.86 
 
 
187 aa  66.6  2e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  64 
 
 
186 aa  66.2  2e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  45.59 
 
 
219 aa  65.1  5e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.16241e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  63.27 
 
 
185 aa  64.3  7e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  54.1 
 
 
189 aa  64.3  7e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  37.27 
 
 
212 aa  64.3  8e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  40.4 
 
 
192 aa  63.9  1e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  42.17 
 
 
193 aa  62.8  2e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  60 
 
 
178 aa  63.2  2e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>