56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0500 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3843  hypothetical protein  91.76 
 
 		 364 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0476  hypothetical protein  90.66 
 
 		 349 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0497  hypothetical protein  90.93 
 
 		 349 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3671  response regulator receiver protein  45.84 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3494  hypothetical protein  47.03 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0458  hypothetical protein  44.81 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4121  hypothetical protein  44.8 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0552  hypothetical protein  51.94 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3759  hypothetical protein  29.95 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4425  hypothetical protein  47.46 
 
 		 239 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0446  hypothetical protein  54.21 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0535  hypothetical protein  46.74 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3777  hypothetical protein  37.69 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0380  hypothetical protein  41.12 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0306  hypothetical protein  42.74 
 
 		 232 aa  96.3  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3355  hypothetical protein  35.91 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3760  hypothetical protein  35.62 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.693431  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1861  hypothetical protein  39.22 
 
 		 217 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2113  hypothetical protein  38.24 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.674984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  42.86 
 
 		 1247 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  42.86 
 
 		 822 aa  56.2  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1485  ATPase  36.23 
 
 		 1761 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  42.11 
 
 		 895 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  47.46 
 
 		 1359 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  40.35 
 
 		 1135 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  42.11 
 
 		 945 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  32.03 
 
 		 937 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1097 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  40 
 
 		 1124 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  40 
 
 		 1115 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  40 
 
 		 1110 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  40 
 
 		 1129 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1148 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1149 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1147 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  38.98 
 
 		 957 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1143 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  45.28 
 
 		 806 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  34.74 
 
 		 826 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  37.08 
 
 		 924 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  36.67 
 
 		 927 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  44.23 
 
 		 914 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  45.28 
 
 		 870 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  45.1 
 
 		 1162 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1482 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  39.06 
 
 		 931 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  36.49 
 
 		 1245 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  41.07 
 
 		 1408 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  45.28 
 
 		 1057 aa  46.2  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1273 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  40.98 
 
 		 744 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1036 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  39.62 
 
 		 1621 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  37.68 
 
 		 952 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  36.99 
 
 		 1454 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>