More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0372 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  100 
 
 
226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  96.44 
 
 
245 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  96 
 
 
245 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  96 
 
 
245 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  93.33 
 
 
227 aa  440  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  83.11 
 
 
238 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  84.68 
 
 
238 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  84.16 
 
 
234 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  82.67 
 
 
238 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  71.3 
 
 
224 aa  333  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  72.65 
 
 
225 aa  333  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  68.02 
 
 
230 aa  328  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  67.71 
 
 
224 aa  314  7e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  67.26 
 
 
224 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  67.26 
 
 
224 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  67.26 
 
 
224 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  68.61 
 
 
224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  65.92 
 
 
224 aa  308  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  66.22 
 
 
233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  64.57 
 
 
224 aa  301  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  66.22 
 
 
226 aa  295  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  61.33 
 
 
228 aa  293  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  60.36 
 
 
229 aa  289  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  60.81 
 
 
225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  60.36 
 
 
225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  60.36 
 
 
225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  60.36 
 
 
225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  60.36 
 
 
225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  60.36 
 
 
225 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  59.46 
 
 
225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  59.91 
 
 
225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  59.91 
 
 
225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  59.01 
 
 
225 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  59.46 
 
 
225 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  59.46 
 
 
225 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  59.46 
 
 
225 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  59.46 
 
 
225 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  59.91 
 
 
225 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  56.95 
 
 
224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  37.23 
 
 
230 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  37.23 
 
 
230 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  37.44 
 
 
236 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  37.44 
 
 
236 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.44 
 
 
236 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  37.44 
 
 
236 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.9 
 
 
236 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  37 
 
 
236 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  37.44 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  37.44 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37 
 
 
236 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.12 
 
 
236 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  32.44 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  33.77 
 
 
231 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  33.77 
 
 
231 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  32.14 
 
 
231 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  32.14 
 
 
231 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.7 
 
 
231 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.14 
 
 
231 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  31.7 
 
 
231 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32 
 
 
231 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  31.7 
 
 
231 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.7 
 
 
231 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  30.67 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  31.3 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  31.72 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  32.04 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
242 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.22 
 
 
227 aa  106  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.17 
 
 
229 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  30.22 
 
 
225 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  28.97 
 
 
230 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  30.87 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.73 
 
 
254 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.45 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.78 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  30.6 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  33.33 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.85 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.87 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  30.13 
 
 
235 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
225 aa  92  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
225 aa  92  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 
228 aa  89  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  27.56 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.62 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  35.77 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.28 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.31 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  34.15 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.98 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  34.48 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  24.89 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.84 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  34.15 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  34.96 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  35.77 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>