More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0360 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
127 aa  259  9e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
127 aa  259  9e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
127 aa  259  9e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  6.17851e-09 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  97.64 
 
 
127 aa  255  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  97.64 
 
 
127 aa  254  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  99.21 
 
 
127 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  96.85 
 
 
127 aa  253  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  96.85 
 
 
127 aa  253  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  97.64 
 
 
127 aa  253  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  86.61 
 
 
127 aa  228  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  86.61 
 
 
127 aa  227  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  85.04 
 
 
127 aa  223  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  85.04 
 
 
127 aa  223  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  83.46 
 
 
127 aa  218  2e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  82.68 
 
 
127 aa  218  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  83.46 
 
 
127 aa  216  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  2.30833e-08 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  75.81 
 
 
128 aa  200  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  71.77 
 
 
127 aa  191  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  70.16 
 
 
128 aa  188  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  71.31 
 
 
128 aa  187  3e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  72.95 
 
 
126 aa  187  6e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  72.95 
 
 
126 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  72.13 
 
 
126 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  72.13 
 
 
126 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  72.13 
 
 
126 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  70.97 
 
 
126 aa  184  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  70.97 
 
 
126 aa  183  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  70.16 
 
 
126 aa  182  2e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  70.49 
 
 
126 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  67.2 
 
 
129 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  66.93 
 
 
128 aa  177  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  69.35 
 
 
129 aa  177  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  68.03 
 
 
126 aa  176  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  68.85 
 
 
126 aa  176  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  67.2 
 
 
127 aa  176  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  64.52 
 
 
128 aa  174  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  67.21 
 
 
127 aa  172  1e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  6.06003e-08 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  64.75 
 
 
128 aa  172  2e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  64.52 
 
 
127 aa  171  4e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  69.6 
 
 
128 aa  171  4e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  66.12 
 
 
128 aa  170  6e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  65.29 
 
 
128 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  62.3 
 
 
128 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 
129 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  62.4 
 
 
129 aa  154  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  60.66 
 
 
130 aa  154  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  60.48 
 
 
127 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  64.8 
 
 
126 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  59.68 
 
 
148 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  58.2 
 
 
126 aa  139  1e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 
128 aa  139  1e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 
126 aa  138  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  54.62 
 
 
126 aa  138  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  55.74 
 
 
126 aa  137  4e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
129 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  8.90707e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  51.24 
 
 
129 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  54.17 
 
 
151 aa  133  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 
151 aa  133  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
130 aa  132  2e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  1.4394e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
127 aa  129  1e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 
126 aa  126  1e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.09658e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 
129 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
132 aa  121  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
128 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
131 aa  120  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.28511e-07  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  47.86 
 
 
126 aa  119  1e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 
127 aa  119  2e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 
140 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 
125 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 
127 aa  116  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  49.15 
 
 
128 aa  115  1e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 
126 aa  115  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.86 
 
 
126 aa  115  2e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
125 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 
127 aa  114  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 
143 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 
126 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 
126 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  40.94 
 
 
143 aa  114  4e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 
125 aa  114  4e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
130 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  45.97 
 
 
135 aa  114  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
128 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 
129 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 
125 aa  113  9e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 
128 aa  112  1e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 
126 aa  112  1e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 
124 aa  112  1e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 
128 aa  112  2e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 
129 aa  111  4e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  2.24932e-05 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 
124 aa  111  4e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 
126 aa  110  4e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 
124 aa  110  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 
125 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  43.22 
 
 
126 aa  110  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  46.28 
 
 
126 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 
129 aa  110  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 
126 aa  110  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  2.0508e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 
124 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  45.08 
 
 
127 aa  110  8e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>