More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0359 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
554 aa  1145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  1.00216e-10 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  79.31 
 
 
551 aa  942  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.6311e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  92.78 
 
 
554 aa  1056  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  93.86 
 
 
554 aa  1089  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  99.28 
 
 
554 aa  1138  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  80.4 
 
 
575 aa  937  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  93.5 
 
 
554 aa  1085  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  80.76 
 
 
551 aa  956  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.31553e-06  unclonable  3.87525e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  93.5 
 
 
554 aa  1084  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  80.22 
 
 
555 aa  959  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  99.1 
 
 
554 aa  1136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.14911e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  80.22 
 
 
551 aa  957  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  9.98406e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  94.4 
 
 
554 aa  1098  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  81.13 
 
 
551 aa  957  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  80.4 
 
 
555 aa  954  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  99.82 
 
 
554 aa  1143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  48.99 
 
 
559 aa  573  1e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.18 
 
 
563 aa  562  1e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.64 
 
 
563 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.73 
 
 
563 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  48.8 
 
 
546 aa  541  1e-152  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  46.89 
 
 
547 aa  514  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  47.93 
 
 
558 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  44.77 
 
 
546 aa  506  1e-142  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  43.64 
 
 
547 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  42.57 
 
 
555 aa  468  1e-130  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  44.36 
 
 
547 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 
555 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  43.09 
 
 
563 aa  452  1e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  45.52 
 
 
559 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 
560 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 
551 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  41.14 
 
 
555 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  40.96 
 
 
555 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  40.22 
 
 
555 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  40.37 
 
 
555 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  40.22 
 
 
598 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  40.22 
 
 
598 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 
566 aa  405  1e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  40.61 
 
 
553 aa  407  1e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  40.04 
 
 
553 aa  407  1e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 
607 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
607 aa  280  7e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 
609 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.37 
 
 
610 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.57 
 
 
610 aa  265  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 
610 aa  263  5e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 
618 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 
626 aa  257  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 
610 aa  255  2e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 
633 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 
615 aa  253  4e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.51 
 
 
599 aa  254  4e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 
605 aa  253  5e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
623 aa  252  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 
610 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.06 
 
 
592 aa  251  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
600 aa  251  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 
604 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
633 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  30.05 
 
 
604 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 
616 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 
603 aa  246  7e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.42642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 
590 aa  245  1e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
590 aa  245  1e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
620 aa  245  2e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.05 
 
 
604 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
592 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 
597 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 
596 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 
607 aa  241  3e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 
594 aa  240  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 
607 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 
606 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  3.27223e-05 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 
599 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.91 
 
 
587 aa  235  1e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 
663 aa  236  1e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.79 
 
 
602 aa  233  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
617 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  30.9 
 
 
607 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 
593 aa  232  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
597 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.90287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 
602 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 
645 aa  231  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
622 aa  230  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 
612 aa  229  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 
598 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
672 aa  229  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 
605 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  29.33 
 
 
679 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 
601 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 
612 aa  227  5e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 
603 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90316e-12 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 
613 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.97 
 
 
598 aa  224  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 
610 aa  223  5e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
603 aa  223  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 
608 aa  223  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 
612 aa  223  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 
773 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>