More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0347 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  70.26 
 
 		 454 aa  683    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  90.97 
 
 		 454 aa  851    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  99.34 
 
 		 454 aa  923    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  70.7 
 
 		 454 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  68.06 
 
 		 453 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  931    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  99.12 
 
 		 454 aa  925    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  69.16 
 
 		 459 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  95.81 
 
 		 454 aa  896    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  91.41 
 
 		 454 aa  858    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  91.41 
 
 		 454 aa  858    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  67.03 
 
 		 455 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  91.19 
 
 		 454 aa  857    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  99.56 
 
 		 454 aa  926    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  68.57 
 
 		 459 aa  624  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  38.73 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 562 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  38.23 
 
 		 457 aa  269  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  36.38 
 
 		 563 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  41.54 
 
 		 524 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 568 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 551 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 615 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 563 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 		 563 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 563 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  37.24 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 		 561 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 565 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  35.27 
 
 		 591 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  34.27 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  30.55 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.26 
 
 		 518 aa  113  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  29.56 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  26.15 
 
 		 450 aa  103  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 570 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  25.96 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.61 
 
 		 565 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.36 
 
 		 569 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  29.06 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.02 
 
 		 565 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  28.3 
 
 		 609 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  27.07 
 
 		 448 aa  89.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  27.59 
 
 		 609 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  28.29 
 
 		 443 aa  87  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  30.58 
 
 		 393 aa  86.7  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  27.34 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  27.34 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  28.02 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  29.02 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  27.11 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.73 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  26.58 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  24.04 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  24.77 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  24.72 
 
 		 650 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  23.2 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  24.62 
 
 		 1070 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  22.12 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  23.8 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0103  4-coumarate--CoA ligase  28.45 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  24.39 
 
 		 667 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  23.58 
 
 		 666 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0951  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  22.88 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  23.58 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0932  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  22.88 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.210053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  24.82 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  23.31 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  24.36 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  25.98 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1677  amino acid adenylation domain-containing protein  25.14 
 
 		 1058 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  23.04 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  26.59 
 
 		 517 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3454  amino acid adenylation domain protein  24.66 
 
 		 1339 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624608  decreased coverage  0.0000000205264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  22.99 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  21.87 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  23.26 
 
 		 664 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  21.87 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  23.31 
 
 		 667 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  22.38 
 
 		 1370 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4522  acyl-CoA synthetase  24.44 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2685  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  25.59 
 
 		 328 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  23.29 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  22.06 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  23.33 
 
 		 653 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  22.73 
 
 		 4332 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  22.69 
 
 		 667 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  22.83 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  21.82 
 
 		 660 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  21.82 
 
 		 664 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>