More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0327 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 107 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  99.07 
 
 		 107 aa  219  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  99.07 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  98.13 
 
 		 107 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  94.39 
 
 		 108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  94.39 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  94.39 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  93.46 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  76.42 
 
 		 112 aa  173  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  68.87 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  61.17 
 
 		 105 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  63.55 
 
 		 106 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  45.79 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  44.09 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  42.35 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  41.11 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  37.36 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.71 
 
 		 550 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  38.3 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  47.69 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  45.95 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38.04 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40 
 
 		 562 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.05 
 
 		 837 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  39.19 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.2 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.69 
 
 		 834 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.97 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 277 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  38.16 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0016  GlpE protein  30 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  39.44 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  34.67 
 
 		 565 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  39.73 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  37.31 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  39.02 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  32.91 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  39.39 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.84 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  43.24 
 
 		 361 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  37.88 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  39.51 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.71 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 		 464 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  32.91 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  32.91 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  32.91 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  32.91 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.1 
 
 		 568 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 459 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  29.21 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.02 
 
 		 560 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  32.91 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.62 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  39.19 
 
 		 471 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  32.91 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>