26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0304 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  93.98 
 
 
86 aa  137  5e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.63282e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0299  hypothetical protein  82.89 
 
 
78 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000880989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0300  hypothetical protein  91.04 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00679932  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  57.38 
 
 
63 aa  61.6  3e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  64 
 
 
59 aa  60.5  8e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  64.58 
 
 
67 aa  57.8  6e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0402  hypothetical protein  77.08 
 
 
54 aa  56.6  1e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000918691  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  55.77 
 
 
62 aa  55.8  2e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0117  hypothetical protein  70.73 
 
 
53 aa  55.5  3e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4421  hypothetical protein  69.49 
 
 
60 aa  53.5  9e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  65.91 
 
 
54 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2885  hypothetical protein  75 
 
 
64 aa  52  3e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  61.7 
 
 
51 aa  51.2  5e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  59.57 
 
 
51 aa  50.4  9e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  65.12 
 
 
51 aa  50.1  1e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0287  hypothetical protein  73.91 
 
 
63 aa  49.3  2e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.39094e-07  hitchhiker  8.63491e-10 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4779  hypothetical protein  77.78 
 
 
49 aa  47.8  5e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.151068  unclonable  7.88092e-09 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1538  hypothetical protein  67.5 
 
 
53 aa  47.4  6e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.038639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0095  hypothetical protein  63.08 
 
 
68 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4387  hypothetical protein  70.59 
 
 
52 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1658  hypothetical protein  47.17 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.222694  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3732  hypothetical protein  73.91 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00346538  unclonable  2.04974e-05 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0777  hypothetical protein  51.11 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0112  hypothetical protein  82.05 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0287  hypothetical protein  84.85 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000322851  decreased coverage  1.41072e-09 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>