63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0257 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  357  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.18811e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  100 
 
 
174 aa  357  6e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  6.63543e-06  decreased coverage  1.15808e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  97.13 
 
 
174 aa  323  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.30973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  95.98 
 
 
174 aa  321  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  79.31 
 
 
163 aa  260  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.05349e-05  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  77.59 
 
 
163 aa  257  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  5.50011e-05  hitchhiker  1.61676e-09 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  75.29 
 
 
163 aa  253  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.28053e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  71.84 
 
 
163 aa  237  6e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  48.45 
 
 
168 aa  134  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.25037e-06  unclonable  8.29203e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  42.86 
 
 
163 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.63608e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  42.24 
 
 
154 aa  120  1e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.26692e-08  unclonable  2.42912e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  42.41 
 
 
147 aa  108  4e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  2.21664e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  40.62 
 
 
160 aa  107  7e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.05476e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  38.32 
 
 
181 aa  101  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.6442e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  41.61 
 
 
163 aa  101  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.29305e-05  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  35.61 
 
 
158 aa  73.2  2e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  37.19 
 
 
161 aa  71.2  6e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  37.19 
 
 
161 aa  71.2  6e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  31.21 
 
 
157 aa  68.9  3e-11  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  36.36 
 
 
161 aa  68.9  3e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  36.36 
 
 
161 aa  68.9  3e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  35.54 
 
 
156 aa  67.8  8e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  35.77 
 
 
162 aa  67  1e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  35.54 
 
 
161 aa  67  1e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  35.54 
 
 
161 aa  67  1e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  35.54 
 
 
161 aa  67  1e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  35.54 
 
 
161 aa  67  1e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  35.16 
 
 
161 aa  64.7  6e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  35.16 
 
 
161 aa  64.7  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  35.16 
 
 
161 aa  64.7  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  35.16 
 
 
161 aa  64.7  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  35.16 
 
 
161 aa  64.3  8e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.48 
 
 
162 aa  57.8  7e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.48 
 
 
162 aa  57.8  7e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.48 
 
 
162 aa  57.8  7e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.37772e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  29.13 
 
 
162 aa  54.3  8e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  26.97 
 
 
170 aa  52.8  2e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  37 
 
 
168 aa  52  4e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  2.03252e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  31.4 
 
 
152 aa  52  4e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  7.49705e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  35.96 
 
 
169 aa  52  4e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  35.77 
 
 
170 aa  52  5e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.85493e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  28.29 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  28.29 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  28.29 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  28.29 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  28.29 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  28.29 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  26.32 
 
 
167 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  29.59 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  33.03 
 
 
159 aa  50.8  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  28.29 
 
 
166 aa  50.4  1e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  30.25 
 
 
162 aa  50.1  2e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  26.8 
 
 
166 aa  50.1  2e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.56086e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  34.74 
 
 
185 aa  49.7  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  26.53 
 
 
166 aa  47.4  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  6.13131e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  26.53 
 
 
166 aa  47.4  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  26.53 
 
 
166 aa  47.4  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  26.53 
 
 
166 aa  47.4  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  28.21 
 
 
166 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  27.04 
 
 
147 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  26.71 
 
 
159 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  3.64222e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  28.07 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3120  hypothetical protein  27.81 
 
 
158 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>