More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0174 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  87.02 
 
 		 207 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  57.77 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  56.8 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  56.8 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  55.39 
 
 		 236 aa  240  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  55.39 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  53.66 
 
 		 209 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  50.24 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  53.66 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  52.68 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  52.68 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  48.04 
 
 		 207 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  48.29 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  48.29 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1863  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3412  LuxR family DNA-binding response regulator  46.57 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  39.05 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  41.55 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  36.14 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  37.07 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  37.07 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  37.07 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  39.02 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  37.07 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  37.07 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  39.51 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.17 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  33.17 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  33.17 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  33.17 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  32.68 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  32.68 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  32.2 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.98 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  32.64 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1808  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000516369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  32.44 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 216 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.99 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  32.37 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  32.37 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 217 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  32.47 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  32.47 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.04 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.51 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>