68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0100 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1270    100 
 
 		 3351 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2608    100 
 
 		 2160 bp  2416    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1397    100 
 
 		 2376 bp  2415    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1299    100 
 
 		 2847 bp  2415    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1229    100 
 
 		 903 bp  1790    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.00000000126373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0992    100 
 
 		 2348 bp  1800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0215553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0991    100 
 
 		 6392 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2784    100 
 
 		 2520 bp  2416    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997058  normal  0.532998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3863    97.3 
 
 		 1109 bp  1955    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 		 1110 bp  2192    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4171    100 
 
 		 2922 bp  2418    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 		 1110 bp  2192    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0096  GntR family transcriptional regulator  95.56 
 
 		 708 bp  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 		 1110 bp  2192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 		 1110 bp  2192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 		 1110 bp  2192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 		 1110 bp  2192    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  96.3 
 
 		 708 bp  684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  95.06 
 
 		 708 bp  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0446    97.3 
 
 		 1109 bp  1955    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0471    97.3 
 
 		 1109 bp  1955    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0593  transposase IS4 family protein  97.34 
 
 		 864 bp  1530    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  99.91 
 
 		 1110 bp  2192    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0100    100 
 
 		 1935 bp  3836    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1110 bp  2200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0600    97.3 
 
 		 1109 bp  1955    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0594  hypothetical protein  96.85 
 
 		 348 bp  597  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.761756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  91.86 
 
 		 708 bp  509  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1230    100 
 
 		 216 bp  428  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000843272 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0098  histidine utilization repressor  83.28 
 
 		 708 bp  208  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0096  histidine utilization repressor  83.18 
 
 		 708 bp  208  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0099  histidine utilization repressor  82.65 
 
 		 708 bp  192  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0093  histidine utilization repressor  82.65 
 
 		 708 bp  192  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  89.77 
 
 		 702 bp  103  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  84.3 
 
 		 705 bp  89.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  89.33 
 
 		 702 bp  85.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  84.62 
 
 		 744 bp  79.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  100 
 
 		 708 bp  65.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  81.52 
 
 		 708 bp  48.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>