13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0097 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0470    97.04 
 
 
2052 bp  2113    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0097    100 
 
 
4365 bp  8653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0169    100 
 
 
2511 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0171    100 
 
 
1962 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0642    100 
 
 
2511 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0765    100 
 
 
1764 bp  2416    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.460352  normal  0.362308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2563    100 
 
 
2139 bp  2415    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133274  hitchhiker  0.00000122058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3013    100 
 
 
1845 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.187136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3219    100 
 
 
3906 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3605    100 
 
 
1797 bp  2418    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4105    100 
 
 
3189 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4395    100 
 
 
3123 bp  2415    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00345264  decreased coverage  0.00443856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0442  hypothetical protein  100 
 
 
1851 bp  58  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>