122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0095 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  98.39 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  96.77 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  95.7 
 
 		 186 aa  362  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  84.06 
 
 		 143 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  75.35 
 
 		 142 aa  227  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  75.35 
 
 		 142 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  74.65 
 
 		 142 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 144 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  25.55 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  27.78 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  24.09 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  24.29 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  27.87 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  26.67 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  26.98 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  28.39 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  22.38 
 
 		 306 aa  44.7  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  30.17 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1198  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  24.72 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 180 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 159 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 168 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 309 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 164 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 163 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 143 aa  41.6  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 148 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>