38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0090 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  92.88 
 
 
337 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  93.18 
 
 
337 aa  648    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  97.33 
 
 
337 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  96.74 
 
 
337 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  93.18 
 
 
337 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  96.44 
 
 
337 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  40.36 
 
 
337 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  39.35 
 
 
338 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  37.46 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  29.61 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  30.84 
 
 
340 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  28.36 
 
 
345 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  30.34 
 
 
338 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  28.53 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  29.22 
 
 
345 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  28.74 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  28.92 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  28.74 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  28.74 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  28.74 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  31.72 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  28.78 
 
 
323 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  31.39 
 
 
364 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  31.39 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  30.94 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  31.84 
 
 
360 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  26.75 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  25.47 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  24.21 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  27.13 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  29.56 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  23.73 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  22.63 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  24.73 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  24.67 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  22.45 
 
 
330 aa  57  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  27.13 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>