More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0062 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  100 
 
 		 164 aa  322  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  100 
 
 		 154 aa  321  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  99.35 
 
 		 164 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  99.35 
 
 		 164 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  92.86 
 
 		 159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  92.86 
 
 		 159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  92.86 
 
 		 159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  92.21 
 
 		 154 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  90.91 
 
 		 154 aa  297  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  54.79 
 
 		 179 aa  167  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  58.14 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  55 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  57.5 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  50.66 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  48.98 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  47.33 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  48.95 
 
 		 172 aa  147  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  48.95 
 
 		 194 aa  146  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  48.95 
 
 		 194 aa  146  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  47.33 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  48.25 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 190 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 190 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 190 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  46.38 
 
 		 189 aa  140  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  47.1 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  42.33 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  43.33 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  50.4 
 
 		 205 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  42.95 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.95 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  43.59 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  42.95 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  43.59 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  43.59 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  43.59 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  43.59 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  45.65 
 
 		 191 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.31 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  42.95 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  45.65 
 
 		 191 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  44.52 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  43.51 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  44.81 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  43.23 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  43.23 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  41.55 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  41.55 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  41.55 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  50.42 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  41.55 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  40.61 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  44.55 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 265 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 188 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  38.13 
 
 		 231 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 333 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 246 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  39.76 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  43.7 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  38.85 
 
 		 211 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  45.3 
 
 		 195 aa  104  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  49.54 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  42.86 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  47.71 
 
 		 234 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  39.62 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 274 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 224 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  46.79 
 
 		 218 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  46.79 
 
 		 218 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  46.79 
 
 		 218 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  46.79 
 
 		 218 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  46.79 
 
 		 234 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  44.95 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  46.79 
 
 		 234 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  46.79 
 
 		 234 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  36.31 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>