More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0021 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  93.62 
 
 
439 aa  867    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  77.63 
 
 
440 aa  725    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  99.55 
 
 
440 aa  915    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  80.37 
 
 
439 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  74.49 
 
 
440 aa  702    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  79.55 
 
 
440 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  78.59 
 
 
439 aa  750    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  100 
 
 
440 aa  919    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  99.77 
 
 
440 aa  917    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  94.31 
 
 
439 aa  870    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  94.76 
 
 
439 aa  875    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  77.73 
 
 
439 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  99.77 
 
 
440 aa  918    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  97.95 
 
 
440 aa  900    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  94.99 
 
 
439 aa  877    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  74.72 
 
 
439 aa  707    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  56.29 
 
 
443 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  58.69 
 
 
443 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  57.24 
 
 
448 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  53.85 
 
 
443 aa  481  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  51.36 
 
 
443 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  51.47 
 
 
443 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  53.17 
 
 
443 aa  477  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  51.13 
 
 
443 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  50.9 
 
 
443 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  51.13 
 
 
443 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  51.47 
 
 
443 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  50.45 
 
 
443 aa  461  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  49.89 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  49.89 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  49.89 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  49.89 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  49.89 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  49.89 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  49.89 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  49.66 
 
 
443 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  49.66 
 
 
443 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  48.77 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  48.77 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  48.77 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  48.77 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  48.77 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  47.1 
 
 
492 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  46.05 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  40.65 
 
 
429 aa  292  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  37.62 
 
 
433 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  37.28 
 
 
470 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  30 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  30.25 
 
 
443 aa  146  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  28.23 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  27.98 
 
 
469 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  32.28 
 
 
475 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  27.16 
 
 
490 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  27.47 
 
 
454 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  26.93 
 
 
439 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  31.02 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  33.44 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  28.4 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  31.94 
 
 
452 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  28.13 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  31.85 
 
 
463 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  28.9 
 
 
433 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  31.03 
 
 
437 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  29.54 
 
 
442 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  31.03 
 
 
437 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  30.35 
 
 
514 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  30.14 
 
 
458 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  34.68 
 
 
436 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  26.5 
 
 
462 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  29.32 
 
 
442 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  27.57 
 
 
437 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  30.07 
 
 
454 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  26.74 
 
 
437 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  27.31 
 
 
473 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  28.17 
 
 
439 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  34.57 
 
 
441 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  28.38 
 
 
454 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  31.72 
 
 
437 aa  123  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  33.68 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.38 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  30.72 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  31.38 
 
 
441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  29.75 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  31.4 
 
 
461 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  31.34 
 
 
436 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  26.97 
 
 
436 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  29.84 
 
 
459 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  31.36 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  32.06 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  26.58 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  31.47 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  27.94 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  29.33 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  26.51 
 
 
493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  30.27 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  31.47 
 
 
441 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  30.8 
 
 
444 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  26.77 
 
 
458 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  31.47 
 
 
441 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04951  putative aminopeptidase P  29.77 
 
 
425 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>