38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0016 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  306  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  98.65 
 
 
148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  97.97 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  97.97 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  82.43 
 
 
150 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  81.94 
 
 
145 aa  248  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  81.25 
 
 
145 aa  247  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  81.25 
 
 
145 aa  245  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  81.82 
 
 
145 aa  239  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  67.81 
 
 
146 aa  207  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  65.97 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  62.33 
 
 
146 aa  196  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  65.49 
 
 
147 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  65.49 
 
 
149 aa  192  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  60.69 
 
 
145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  41.33 
 
 
151 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  39.47 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  25.83 
 
 
181 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  28.17 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  31.72 
 
 
184 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  31.5 
 
 
206 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  30.67 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  33.99 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  29.17 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  25.52 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  30.47 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  29.84 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  25.85 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  25.6 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  25.64 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000026195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  27.21 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  27.08 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  25.69 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  23.02 
 
 
211 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  23.45 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  23.45 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>