269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4687 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  100 
 
 
228 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  100 
 
 
228 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  95.18 
 
 
228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  58.04 
 
 
231 aa  240  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  44.14 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.66 
 
 
228 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  36.07 
 
 
228 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  38.05 
 
 
226 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.49 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.04 
 
 
237 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  37.78 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.04 
 
 
238 aa  138  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  38.12 
 
 
238 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  36.71 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  32.74 
 
 
252 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  31.08 
 
 
260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  28.44 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  30.39 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  29.18 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.51 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  27.78 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.66 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.21 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.11 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.32 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  31.16 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.17 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  28.64 
 
 
228 aa  62  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.56 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  27 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  26.13 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.76 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.87 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  31.88 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.35 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
192 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.37 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.37 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.37 
 
 
231 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.37 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.17 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  28.47 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.85 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.14 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.54 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  24.02 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.02 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 
216 aa  55.1  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.94 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  25.62 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.51 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.77 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  28.03 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  21.4 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.48 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  25.17 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.29 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.88 
 
 
276 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  25.49 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  27.46 
 
 
209 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.47 
 
 
229 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 
212 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.35 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.35 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.35 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4464  chromosome partitioning ATPase  26.42 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.763597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.35 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  26.88 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  28.79 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>