195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4668 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  100 
 
 		 1077 aa  2226    Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  67.92 
 
 		 1448 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  67.24 
 
 		 1580 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  67.58 
 
 		 1448 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  66.67 
 
 		 1495 aa  426  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  65.65 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  65.19 
 
 		 986 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  37.88 
 
 		 357 aa  209  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  40.51 
 
 		 320 aa  196  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  34.46 
 
 		 384 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  39.93 
 
 		 321 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  36.58 
 
 		 328 aa  188  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  37.36 
 
 		 1716 aa  188  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  38.85 
 
 		 332 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  38.85 
 
 		 332 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  38.49 
 
 		 332 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3508  hypothetical protein  45.12 
 
 		 241 aa  185  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  37.29 
 
 		 333 aa  184  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  38.82 
 
 		 312 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  45.12 
 
 		 341 aa  184  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  39.07 
 
 		 314 aa  183  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  38.85 
 
 		 434 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  35.37 
 
 		 319 aa  182  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  37.92 
 
 		 285 aa  181  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  39.54 
 
 		 1457 aa  177  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  35.06 
 
 		 335 aa  177  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  35.14 
 
 		 336 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  38.16 
 
 		 294 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  34.82 
 
 		 322 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  36.79 
 
 		 311 aa  176  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  39 
 
 		 362 aa  175  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  35.06 
 
 		 344 aa  174  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  39.22 
 
 		 1449 aa  174  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  37.18 
 
 		 326 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  37.18 
 
 		 326 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  38.06 
 
 		 312 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  37.23 
 
 		 295 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  37.85 
 
 		 300 aa  171  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.18 
 
 		 323 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  36.77 
 
 		 315 aa  167  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  47.06 
 
 		 621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  36.64 
 
 		 320 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  35.23 
 
 		 321 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  38.3 
 
 		 285 aa  166  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  36.51 
 
 		 311 aa  166  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  47.06 
 
 		 354 aa  164  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  35.26 
 
 		 320 aa  164  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  35.79 
 
 		 316 aa  164  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  36.7 
 
 		 299 aa  164  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  35.31 
 
 		 317 aa  164  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  36.4 
 
 		 284 aa  162  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  36.64 
 
 		 308 aa  162  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  35.14 
 
 		 326 aa  162  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  34.98 
 
 		 317 aa  162  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  30.96 
 
 		 682 aa  161  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  35.94 
 
 		 301 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  37.33 
 
 		 313 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  35.12 
 
 		 312 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.47 
 
 		 297 aa  158  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  34.58 
 
 		 318 aa  158  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  36.45 
 
 		 338 aa  157  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  35.69 
 
 		 311 aa  157  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  33.22 
 
 		 310 aa  156  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  35.07 
 
 		 304 aa  156  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  33.55 
 
 		 320 aa  156  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  33.55 
 
 		 320 aa  156  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  34.87 
 
 		 296 aa  155  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  34.36 
 
 		 299 aa  154  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  34.26 
 
 		 301 aa  153  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  33.44 
 
 		 660 aa  154  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  153  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  36.64 
 
 		 327 aa  152  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  35.08 
 
 		 318 aa  152  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  32.54 
 
 		 319 aa  149  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  35.1 
 
 		 313 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  34.69 
 
 		 280 aa  147  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  34.17 
 
 		 300 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  31.6 
 
 		 319 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  33.33 
 
 		 308 aa  145  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  33.92 
 
 		 316 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  25.99 
 
 		 411 aa  143  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  27.07 
 
 		 408 aa  142  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  32.09 
 
 		 322 aa  142  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  33.89 
 
 		 288 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  32.86 
 
 		 299 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  34.28 
 
 		 308 aa  137  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  34.41 
 
 		 316 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  32.13 
 
 		 310 aa  135  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  34.04 
 
 		 308 aa  134  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  31.13 
 
 		 276 aa  134  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  37.1 
 
 		 242 aa  134  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  32.74 
 
 		 308 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  35.34 
 
 		 325 aa  131  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  32.77 
 
 		 306 aa  131  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  26.65 
 
 		 1557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  33.74 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  33.1 
 
 		 308 aa  128  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  29.53 
 
 		 297 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  30.74 
 
 		 296 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  26.81 
 
 		 1389 aa  127  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>