86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4577 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4577  deoxyribonuclease I  100 
 
 		 243 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.5492500000000006e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4415  deoxyribonuclease I  97.53 
 
 		 243 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.69182e-28  decreased coverage  0.000909905 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4599  deoxyribonuclease I  97.53 
 
 		 243 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26401e-21  normal  0.918023 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2580  deoxyribonuclease I  61.67 
 
 		 256 aa  325  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0601  deoxyribonuclease I  58.33 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1458  Deoxyribonuclease I  53.02 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.118773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002464  endonuclease I precursor  39.92 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  38.71 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0022  extracellular deoxyribonuclease  38.84 
 
 		 231 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  40.95 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  39.32 
 
 		 233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  40.72 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2973  deoxyribonuclease I  40.41 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.576725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0544  deoxyribonuclease I  38.68 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  40.6 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  37.8 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000648022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  38.87 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000267909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4133  deoxyribonuclease I  38.33 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3331  deoxyribonuclease I  40.09 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3443  endonuclease I  40.09 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000111641  hitchhiker  0.00909149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  36.4 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3525  deoxyribonuclease I  40.27 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0691  deoxyribonuclease I  39.66 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000438774  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0810  deoxyribonuclease I  40.27 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000171872  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4024  deoxyribonuclease I  37.5 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000163525  decreased coverage  0.000370071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0835  Deoxyribonuclease I  40.27 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000225063  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  38.06 
 
 		 232 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  38.5 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  37.56 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3971  deoxyribonuclease I  38.7 
 
 		 251 aa  151  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  36.51 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  38.5 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  38.06 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3332  endonuclease I  38.43 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.387366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3436  endonuclease I  38.43 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00127424  hitchhiker  0.00168464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3256  endonuclease I  38.43 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000148246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3267  endonuclease I  38.43 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0010351  normal  0.0484419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3340  endonuclease I  38.43 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00611255  normal  0.202483 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  37.04 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0576  deoxyribonuclease I  36.33 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000105466  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  36.84 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  36.84 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  36.44 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  36.44 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  36.44 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  36.44 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  36.44 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1915  deoxyribonuclease I  34.76 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0841  deoxyribonuclease I  37.56 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000239428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3345  endonuclease I  37.56 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  36.03 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0839  endonuclease I  37.56 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2364  endonuclease I  34.31 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1350  deoxyribonuclease I  34.17 
 
 		 232 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2148  deoxyribonuclease I  31.49 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000104352  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28570  DNA-specific endonuclease I  32.77 
 
 		 237 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2493  DNA-specific endonuclease I  33.19 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3521  deoxyribonuclease I  32.91 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.271071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3242  deoxyribonuclease I  33.19 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.187326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2451  deoxyribonuclease I  32.91 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02310  Deoxyribonuclease I  33.78 
 
 		 268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40130  deoxyribonuclease I  33.03 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0550387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  33.06 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0624  deoxyribonuclease I  36.45 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4374  deoxyribonuclease I  36.45 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000699204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  34.85 
 
 		 321 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  31.02 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  34.85 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0256  extracellular deoxyribonuclease  35.29 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  27.35 
 
 		 232 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4481  hypothetical protein  85.71 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.94121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  29.22 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  24.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  29.23 
 
 		 1310 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  29.29 
 
 		 341 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  29.17 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  27.97 
 
 		 617 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  31.15 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  25 
 
 		 539 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  29.37 
 
 		 614 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  26.47 
 
 		 539 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  28.12 
 
 		 542 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  24.82 
 
 		 558 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  25.55 
 
 		 558 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  24.67 
 
 		 538 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  26.4 
 
 		 1503 aa  42  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>