More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4555 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
293 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.9 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  41.52 
 
 
684 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  41.15 
 
 
831 aa  169  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  42.48 
 
 
1402 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.27 
 
 
489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.5 
 
 
490 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.27 
 
 
271 aa  158  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.14 
 
 
393 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.11 
 
 
490 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.94 
 
 
425 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  39.73 
 
 
557 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  38.22 
 
 
961 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  39.91 
 
 
789 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
448 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.03 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.98 
 
 
376 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.21 
 
 
1037 aa  150  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 
341 aa  149  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  38.74 
 
 
1493 aa  149  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.27 
 
 
264 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.68 
 
 
376 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  36.6 
 
 
838 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.86 
 
 
278 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.92 
 
 
528 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.66 
 
 
416 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  38.43 
 
 
254 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.48 
 
 
346 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  41.67 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  37.55 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30.43 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.37 
 
 
380 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.27 
 
 
373 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.43 
 
 
685 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.27 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.13 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.92 
 
 
256 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.53 
 
 
2413 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  29.71 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.26 
 
 
865 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  33.86 
 
 
380 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  34.04 
 
 
839 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
976 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  39.44 
 
 
193 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.38 
 
 
331 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  35.37 
 
 
235 aa  125  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
252 aa  125  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.74 
 
 
342 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  36.56 
 
 
850 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.65 
 
 
523 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  31.58 
 
 
509 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  31.6 
 
 
482 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  30.23 
 
 
509 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  34.17 
 
 
331 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.53 
 
 
1002 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.84 
 
 
241 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  30.23 
 
 
509 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  31.58 
 
 
509 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  35.14 
 
 
331 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  33.62 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.5 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  33.18 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.92 
 
 
552 aa  120  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  39.55 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.16 
 
 
1877 aa  119  6e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.65 
 
 
185 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  34.42 
 
 
464 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  31.97 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  32.58 
 
 
763 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
1032 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  30.63 
 
 
403 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.14 
 
 
274 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  30.32 
 
 
399 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  33.81 
 
 
961 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.86 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.49 
 
 
1261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.05 
 
 
392 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  36.36 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.1 
 
 
505 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  39.2 
 
 
304 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  36.74 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  40.25 
 
 
731 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.03 
 
 
328 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
223 aa  109  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.97 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  32.7 
 
 
680 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  30.37 
 
 
246 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.09 
 
 
890 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  35.26 
 
 
1059 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  38.55 
 
 
234 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  29.57 
 
 
359 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.27 
 
 
811 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  29.26 
 
 
348 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 
316 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  31.08 
 
 
971 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.01 
 
 
347 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>