More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4504 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  72.03 
 
 
714 aa  1088    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  52.37 
 
 
706 aa  743    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  85.71 
 
 
690 aa  1219    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  87.85 
 
 
702 aa  1291    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  86.06 
 
 
701 aa  1252    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  72.83 
 
 
712 aa  1034    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
703 aa  1448    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  91.36 
 
 
706 aa  1332    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  64.64 
 
 
697 aa  962    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  91.36 
 
 
706 aa  1333    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  69.66 
 
 
710 aa  1032    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  70.94 
 
 
712 aa  1048    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  85.73 
 
 
709 aa  1259    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  85.45 
 
 
709 aa  1253    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  85.92 
 
 
697 aa  1268    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  91.5 
 
 
706 aa  1332    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  45.33 
 
 
690 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  44.49 
 
 
699 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  39.33 
 
 
693 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  37.32 
 
 
693 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 
710 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 
770 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 
710 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
706 aa  228  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 
706 aa  228  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 
738 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 
694 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 
743 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 
719 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 
709 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 
757 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.44 
 
 
695 aa  204  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.25 
 
 
724 aa  203  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 
850 aa  203  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 
749 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 
860 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
742 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 
737 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 
726 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.22 
 
 
708 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 
715 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.42 
 
 
696 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 
742 aa  200  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 
721 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.71 
 
 
703 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 
708 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 
740 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 
707 aa  198  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
696 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 
707 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 
726 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 
710 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 
726 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
689 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 
743 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 
711 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.09 
 
 
724 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 
792 aa  191  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 
698 aa  190  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 
708 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 
825 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 
815 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 
825 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 
796 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 
764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.44 
 
 
713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 
710 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
795 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.93 
 
 
709 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
795 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  27.32 
 
 
703 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 
863 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.95 
 
 
711 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 
724 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.54 
 
 
713 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 
701 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 
701 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 
862 aa  181  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 
714 aa  180  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
692 aa  180  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 
796 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 
796 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 
809 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 
817 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 
738 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 
701 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 
796 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 
677 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 
708 aa  179  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 
859 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 
779 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 
714 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 
762 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 
712 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 
709 aa  177  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 
810 aa  177  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 
719 aa  177  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 
701 aa  177  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>