27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4492 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  85.81 
 
 
155 aa  248  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  81.94 
 
 
155 aa  237  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  81.94 
 
 
155 aa  237  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  81.94 
 
 
155 aa  237  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  80.65 
 
 
155 aa  234  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  55.48 
 
 
155 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  57.42 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  55.48 
 
 
155 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  47.74 
 
 
155 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  55.03 
 
 
159 aa  156  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  60.63 
 
 
155 aa  154  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  53.12 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  35.14 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  39.42 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  32.19 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  34.25 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  33.58 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  32.26 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  34.13 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  31.34 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  29.45 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  29.11 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  30.63 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>