36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4400 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  100 
 
 		 683 aa  1422    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  99.85 
 
 		 683 aa  1421    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  37.02 
 
 		 707 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00539  hypothetical protein  43.64 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  44.91 
 
 		 289 aa  272  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3586  hypothetical protein  33 
 
 		 413 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  23.46 
 
 		 688 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  25.2 
 
 		 616 aa  94.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03073  hypothetical protein  29.18 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 694 aa  87.4  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2364  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.87 
 
 		 729 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7605  hypothetical protein  27.35 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.76 
 
 		 617 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  22.43 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7326  integrase family protein  26.07 
 
 		 627 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6480  integrase family protein  26.07 
 
 		 627 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0248  integrase family protein  26.07 
 
 		 627 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4956  hypothetical protein  26.32 
 
 		 619 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.573835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2777  hypothetical protein  26.32 
 
 		 531 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0685332  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  20.4 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  25.12 
 
 		 682 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.33 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.01 
 
 		 650 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  23.6 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  21.89 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  21.89 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.47 
 
 		 650 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  27.36 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 236 aa  53.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  21.05 
 
 		 645 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  20.69 
 
 		 600 aa  50.8  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  20.69 
 
 		 600 aa  50.8  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 568 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  24.41 
 
 		 713 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 694 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0423827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  27.93 
 
 		 714 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>