More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4280 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  98.91 
 
 
274 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  99.64 
 
 
274 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  99.64 
 
 
274 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  87.96 
 
 
274 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  87.59 
 
 
274 aa  507  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  87.59 
 
 
274 aa  507  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  86.86 
 
 
274 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  67.15 
 
 
277 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  61.68 
 
 
274 aa  362  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  55.84 
 
 
274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  38.6 
 
 
274 aa  204  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  35.04 
 
 
290 aa  198  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  39.5 
 
 
289 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  37.85 
 
 
275 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  35.11 
 
 
292 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  37.39 
 
 
275 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  34.98 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  29.58 
 
 
275 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 
280 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  34.93 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  32.23 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.36 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
286 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 
283 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  30 
 
 
293 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.28 
 
 
280 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
297 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 
297 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 
280 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
412 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
340 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
283 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
298 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
282 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.22 
 
 
634 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
284 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
297 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
282 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  26.24 
 
 
292 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
353 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
288 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  29.41 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 
544 aa  99.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 
440 aa  99  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.19 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.89 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  26.96 
 
 
496 aa  97.1  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 
293 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  28.84 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.44 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  25 
 
 
304 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.24 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 
298 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.21 
 
 
397 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  28.11 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.49 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  29.57 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  29.35 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  31.75 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  29.02 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  32.85 
 
 
358 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  27.19 
 
 
326 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  29.02 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  25 
 
 
634 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 
283 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.84 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  28.85 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.2 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.58 
 
 
632 aa  89.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  23.92 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  30.66 
 
 
378 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.06 
 
 
369 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 
407 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  27.86 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  28.57 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  32.63 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.77 
 
 
290 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.19 
 
 
517 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.58 
 
 
297 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.9 
 
 
696 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  32.26 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  28.31 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  28.17 
 
 
724 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.11 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.28 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.78 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>