141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4173 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  89.84 
 
 		 384 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  91.67 
 
 		 384 aa  730    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  91.93 
 
 		 384 aa  731    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  91.93 
 
 		 384 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  98.96 
 
 		 384 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  88.02 
 
 		 384 aa  708    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  98.7 
 
 		 384 aa  776    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  99.22 
 
 		 384 aa  779    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  100 
 
 		 384 aa  784    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  72.92 
 
 		 384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  70.13 
 
 		 385 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  67.53 
 
 		 385 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  65.3 
 
 		 389 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  66.07 
 
 		 389 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  64.01 
 
 		 389 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  38.35 
 
 		 402 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  38.11 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  37.62 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  35.68 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  35.19 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  37.44 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  36.17 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  34.87 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  34.55 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  35.28 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  35.59 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  34.38 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  34.22 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  34.62 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  34.38 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  34.47 
 
 		 403 aa  222  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  33.93 
 
 		 382 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  34.85 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  28.82 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  27.93 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  29.49 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  28.79 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  29.59 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  27.18 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  26.25 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  25.41 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  26.8 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  26.8 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  26.87 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  23.46 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  25.24 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  25.94 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  25.87 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  23.96 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  24.88 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  24.88 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  24.88 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  25.12 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  26.5 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  23.81 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  26.62 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  25.12 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  26.62 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  24.13 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  26.62 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  25.06 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  24.13 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  24.13 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  24.81 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  25.25 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  24.26 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  26.5 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  28.76 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  28.76 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  28.76 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  26.37 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  28.76 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  25.82 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  28.76 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  25.59 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  30.52 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  22.95 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  26.55 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  26.43 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  27.89 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  24.94 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  27.89 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  27.98 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  25.13 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  25.13 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  25.13 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  25.13 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  25.99 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  25.13 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2056  porin Gram-negative type  24.1 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  25.98 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  29.17 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  24.81 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  23.48 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  24.35 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  31.77 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  25.62 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  24.35 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  24.35 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  24.35 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>