More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3987 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  78.89 
 
 
563 aa  915    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  62.84 
 
 
568 aa  712    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  99.47 
 
 
563 aa  1152    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  100 
 
 
563 aa  1157    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  50.1 
 
 
580 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3491  urease domain protein  52.49 
 
 
266 aa  293  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.59 
 
 
569 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.24 
 
 
574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  29.25 
 
 
608 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 
603 aa  210  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  29.19 
 
 
613 aa  210  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  30.58 
 
 
564 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.57 
 
 
542 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  30.74 
 
 
565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.82 
 
 
542 aa  200  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3492  urease domain protein  40.16 
 
 
256 aa  200  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.75 
 
 
616 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  30.62 
 
 
576 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  28.65 
 
 
560 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  29.37 
 
 
537 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  28.16 
 
 
543 aa  187  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  29.3 
 
 
573 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.97 
 
 
601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.88 
 
 
541 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
573 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
564 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.53 
 
 
553 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.79 
 
 
535 aa  178  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
538 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.06 
 
 
545 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.16 
 
 
538 aa  177  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  29.26 
 
 
574 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.21 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.18 
 
 
558 aa  174  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.66 
 
 
569 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 
543 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  27 
 
 
544 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.48 
 
 
590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  26.94 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.21 
 
 
539 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  26.83 
 
 
589 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.32 
 
 
544 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  26.63 
 
 
585 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.72 
 
 
620 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.94 
 
 
556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.18 
 
 
569 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.15 
 
 
596 aa  157  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  28.6 
 
 
556 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.14 
 
 
583 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  27.42 
 
 
580 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.45 
 
 
543 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  27.85 
 
 
537 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.36 
 
 
533 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.17 
 
 
530 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 
553 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.72 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.19 
 
 
546 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.78 
 
 
556 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.07 
 
 
575 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.07 
 
 
575 aa  153  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  27.04 
 
 
529 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.16 
 
 
553 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  27.53 
 
 
544 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.44 
 
 
579 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  25.99 
 
 
580 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.02 
 
 
532 aa  150  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  27.63 
 
 
576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  28.74 
 
 
548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  28.74 
 
 
548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  28.74 
 
 
548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.17 
 
 
550 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.01 
 
 
565 aa  147  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  27.23 
 
 
583 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.66 
 
 
522 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  25.66 
 
 
582 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.59 
 
 
606 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  27.06 
 
 
583 aa  144  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  27.05 
 
 
583 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  27.05 
 
 
583 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.79 
 
 
539 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.48 
 
 
619 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.15 
 
 
548 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  23.48 
 
 
522 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  26.83 
 
 
543 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  23.26 
 
 
522 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.04 
 
 
557 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  23.78 
 
 
522 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  27 
 
 
552 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.26 
 
 
522 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  23.29 
 
 
522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  26.58 
 
 
601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  25.22 
 
 
575 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  23.99 
 
 
522 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.71 
 
 
520 aa  137  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  22.92 
 
 
522 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  22.92 
 
 
522 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  26.28 
 
 
560 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.93 
 
 
544 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  26.14 
 
 
547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.86 
 
 
560 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>