More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3771 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  100 
 
 
303 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  100 
 
 
303 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  96.7 
 
 
303 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  96.37 
 
 
303 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  84.05 
 
 
303 aa  521  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  78.74 
 
 
303 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  78.74 
 
 
303 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  78.07 
 
 
303 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  78.15 
 
 
303 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  63.46 
 
 
301 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  61.79 
 
 
302 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  61.79 
 
 
302 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  63.58 
 
 
304 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  49.17 
 
 
307 aa  279  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  47.68 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  48.33 
 
 
308 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  48.33 
 
 
308 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  48.33 
 
 
308 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  47.84 
 
 
305 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  49.16 
 
 
318 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  47.16 
 
 
308 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  47.25 
 
 
317 aa  263  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  47.18 
 
 
308 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  48.5 
 
 
306 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  47.99 
 
 
309 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  47.99 
 
 
309 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  47.99 
 
 
309 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  47.99 
 
 
314 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  47.99 
 
 
309 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  47.99 
 
 
309 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  47.99 
 
 
309 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  47.16 
 
 
310 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  47.99 
 
 
314 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  47.84 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  47.65 
 
 
309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  47.16 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  47.16 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  47.16 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  47.16 
 
 
309 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  46.82 
 
 
309 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  47.83 
 
 
314 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  44.82 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  45.82 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  46.15 
 
 
308 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  44.52 
 
 
319 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  39.67 
 
 
310 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  39.67 
 
 
310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  44.37 
 
 
302 aa  230  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.52 
 
 
308 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  43.19 
 
 
308 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  42.05 
 
 
307 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  47.68 
 
 
299 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  38.74 
 
 
309 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  43.05 
 
 
308 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  42.9 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  39.4 
 
 
340 aa  213  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  37 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  41.72 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  41.72 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  38.94 
 
 
304 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  38.94 
 
 
304 aa  209  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  41.55 
 
 
307 aa  206  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  40.53 
 
 
310 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.58 
 
 
302 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  40.46 
 
 
302 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.2 
 
 
312 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  40.33 
 
 
316 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  42.72 
 
 
308 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  42.72 
 
 
308 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  35.71 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  40.2 
 
 
306 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  41.06 
 
 
309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  39.2 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  43.09 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  41.95 
 
 
304 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  38.78 
 
 
313 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  41.33 
 
 
308 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  39.07 
 
 
304 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  42.05 
 
 
311 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  42.05 
 
 
311 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.56 
 
 
311 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 
398 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  42.62 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  42.05 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  40.14 
 
 
295 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  41.78 
 
 
321 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.87 
 
 
305 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  39.33 
 
 
305 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  38.13 
 
 
295 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  39.46 
 
 
305 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  40 
 
 
424 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.38 
 
 
305 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0641  Ribokinase  42.21 
 
 
321 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549657  normal  0.680229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  37.8 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.26 
 
 
301 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  40.27 
 
 
305 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  38.8 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  39.2 
 
 
306 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  38.41 
 
 
295 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  38.46 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>