More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3770 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  99.06 
 
 		 318 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  98.74 
 
 		 318 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  100 
 
 		 318 aa  646    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  99.37 
 
 		 318 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  93.08 
 
 		 318 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  92.77 
 
 		 318 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  89.94 
 
 		 318 aa  590  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  89.94 
 
 		 318 aa  591  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  89.31 
 
 		 318 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  83.06 
 
 		 335 aa  535  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  82.64 
 
 		 312 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  82.26 
 
 		 312 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  80.71 
 
 		 311 aa  518  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  78.39 
 
 		 310 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  77.85 
 
 		 322 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  72.58 
 
 		 311 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  72.9 
 
 		 311 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  72.26 
 
 		 311 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  72.26 
 
 		 311 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  71.29 
 
 		 311 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  71.29 
 
 		 311 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  71.29 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  70.97 
 
 		 311 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  71.29 
 
 		 311 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  71.29 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  71.29 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  73.23 
 
 		 313 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  71.29 
 
 		 311 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  70.32 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  70 
 
 		 311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  60 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  58.84 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  53.92 
 
 		 312 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  53.11 
 
 		 313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  47.53 
 
 		 323 aa  282  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  48.75 
 
 		 315 aa  271  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  45.81 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  49.52 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  49.52 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.08 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.54 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.21 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  47.88 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.46 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.7 
 
 		 314 aa  261  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  42.53 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.73 
 
 		 318 aa  255  9e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.95 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.4 
 
 		 321 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  45.6 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  45.95 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.08 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  45.95 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  41.88 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  44.41 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.43 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  44.3 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  48.7 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  41.99 
 
 		 313 aa  245  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.99 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  41.99 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  41.67 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  41.67 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  40.32 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  41.67 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  44.55 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  41.35 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  41.35 
 
 		 313 aa  241  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  43.45 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.83 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  44.41 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  46.62 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  46.62 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0055  ribonucleoside hydrolase RihC  46.28 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0058  ribonucleoside hydrolase RihC  46.28 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.24 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.85 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.54 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.67 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0057  ribonucleoside hydrolase RihC  45.27 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.342327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  40.82 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  44.55 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.22 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0032  ribonucleoside hydrolase RihC  44.22 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  40.71 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0032  ribonucleoside hydrolase RihC  43.89 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0552  ribonucleoside hydrolase RihC  44.41 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00034  ribonucleoside hydrolase 3  43.56 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00939814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  41.75 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.73 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  40.79 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00033  hypothetical protein  43.56 
 
 		 303 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  44.22 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.13 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  42.07 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.09 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.41 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  38.96 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.61 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>