30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3749 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  98.85 
 
 
261 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  98.08 
 
 
261 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  97.7 
 
 
261 aa  517  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  82.38 
 
 
261 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  80.08 
 
 
261 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  79.31 
 
 
261 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  79.31 
 
 
261 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  78.16 
 
 
261 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  56.87 
 
 
267 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  56.92 
 
 
266 aa  300  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  59.53 
 
 
260 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  54.62 
 
 
261 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  55.2 
 
 
259 aa  265  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  43.7 
 
 
259 aa  201  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  45.06 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  43.98 
 
 
256 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  40.47 
 
 
253 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  44.33 
 
 
256 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  26.49 
 
 
418 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  31.62 
 
 
250 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  31.25 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.91 
 
 
1106 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  28.35 
 
 
646 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  26.28 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  29.79 
 
 
223 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  35.42 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  27.18 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  31.18 
 
 
249 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  28.17 
 
 
239 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>