267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3495 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.8003e-08  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  97.82 
 
 
229 aa  468  1e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.19805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  82.97 
 
 
229 aa  415  1e-115  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.53974e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  71.3 
 
 
233 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  70.43 
 
 
233 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  70.43 
 
 
233 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  70.61 
 
 
240 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  77.13 
 
 
225 aa  351  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  68.28 
 
 
240 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  60.09 
 
 
230 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  56.22 
 
 
263 aa  283  1e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  57.69 
 
 
243 aa  281  5e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46435e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  47.03 
 
 
237 aa  220  1e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  47.03 
 
 
237 aa  219  2e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.32202e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  46.85 
 
 
272 aa  218  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  43.78 
 
 
256 aa  195  4e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  42.69 
 
 
259 aa  195  5e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  43.35 
 
 
256 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  38.49 
 
 
241 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  38.96 
 
 
244 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  38.46 
 
 
244 aa  164  2e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  40.45 
 
 
218 aa  161  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  3.01408e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  38.94 
 
 
248 aa  155  5e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  1.929e-10 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  40.18 
 
 
270 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  33.76 
 
 
243 aa  127  1e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  34.05 
 
 
243 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  32.9 
 
 
243 aa  120  1e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  40.82 
 
 
246 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  34.82 
 
 
205 aa  115  4e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  31.86 
 
 
209 aa  111  1e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  35.75 
 
 
248 aa  111  1e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  32.89 
 
 
214 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  32.44 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  32.2 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  30.97 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.83 
 
 
270 aa  88.2  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  6.04594e-05 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  30.04 
 
 
248 aa  82.4  5e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  2.11881e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  33.7 
 
 
236 aa  80.9  2e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.24176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  30.13 
 
 
222 aa  79.7  4e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  7.99679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  49.28 
 
 
131 aa  77  2e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.18001e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  55.56 
 
 
216 aa  76.3  4e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  55.56 
 
 
216 aa  76.3  4e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  51.56 
 
 
216 aa  73.9  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  6.07321e-13 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  35.34 
 
 
230 aa  73.6  2e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  27.71 
 
 
230 aa  72.8  5e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  31.36 
 
 
227 aa  72.4  6e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  26.34 
 
 
215 aa  71.6  9e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  29.13 
 
 
205 aa  71.6  9e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 
135 aa  71.2  1e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  46.97 
 
 
135 aa  71.2  1e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  27.85 
 
 
263 aa  70.5  2e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  27 
 
 
231 aa  70.1  3e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  27.87 
 
 
238 aa  68.6  7e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  28.76 
 
 
229 aa  68.2  9e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  7.91351e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  29.82 
 
 
252 aa  68.2  9e-11  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  31.51 
 
 
278 aa  68.2  1e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.75 
 
 
264 aa  67.4  2e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.96 
 
 
264 aa  67.8  2e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  33.93 
 
 
233 aa  66.2  4e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  30.88 
 
 
233 aa  65.9  6e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  28.85 
 
 
229 aa  65.9  6e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  26.2 
 
 
233 aa  65.5  8e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  44.12 
 
 
135 aa  65.1  8e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  44.12 
 
 
135 aa  65.1  8e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  26.55 
 
 
219 aa  65.1  1e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  28.57 
 
 
230 aa  64.3  1e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  29.05 
 
 
236 aa  64.7  1e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05761e-12 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  29.25 
 
 
219 aa  64.3  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  34.71 
 
 
233 aa  63.5  3e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  26.85 
 
 
284 aa  62  7e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  31.88 
 
 
235 aa  62  8e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  27.89 
 
 
206 aa  61.2  1e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.18 
 
 
247 aa  61.6  1e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.02138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 
210 aa  60.5  2e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.69 
 
 
273 aa  59.3  5e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.7 
 
 
247 aa  58.5  9e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1209  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
205 aa  56.6  3e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  24.22 
 
 
240 aa  56.2  4e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  25.55 
 
 
204 aa  55.8  5e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 
71 aa  55.8  5e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  8.52105e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  30 
 
 
292 aa  55.8  5e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  4.71179e-11 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  26.37 
 
 
216 aa  55.5  7e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  32.54 
 
 
261 aa  55.5  8e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  25.44 
 
 
209 aa  54.7  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 
380 aa  54.7  1e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
107 aa  54.3  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  43.08 
 
 
107 aa  54.3  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  25.33 
 
 
247 aa  54.3  2e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.41 
 
 
245 aa  53.5  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.41 
 
 
245 aa  53.5  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  40.28 
 
 
218 aa  53.1  3e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
196 aa  52.8  4e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  36.76 
 
 
144 aa  52.4  5e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  24.7 
 
 
239 aa  52.4  6e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  40.3 
 
 
71 aa  52.4  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  2.89495e-06 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  27.43 
 
 
233 aa  52  7e-06  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  24.64 
 
 
209 aa  52  8e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  25.65 
 
 
207 aa  51.6  9e-06  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  26.11 
 
 
196 aa  51.6  1e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
128 aa  51.6  1e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.72654e-05  normal  0.646275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>