More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3469 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  100 
 
 		 316 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  98.42 
 
 		 316 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  97.01 
 
 		 301 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  52.43 
 
 		 316 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  58.03 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  48.68 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  35.79 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  36.18 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  34.71 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  34.92 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  34.62 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  34.68 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  34.86 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  34.86 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  36.4 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  33.9 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  34.92 
 
 		 335 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  37.84 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  35.03 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  32.58 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  33.11 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  35.56 
 
 		 356 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  32.45 
 
 		 369 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  32.5 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  31.56 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  35.31 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  35.31 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  30.14 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  30.14 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  30.14 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  30.14 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  29.66 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  31.23 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  32.65 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  30.62 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  33.09 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  30.67 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  29.79 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  30.28 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  31.77 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  28.72 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  33 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  34.15 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  29.29 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  29.07 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.06 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  30.57 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  29.71 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.56 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  26.52 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  26.95 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.71 
 
 		 672 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  26.73 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  23.41 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  27.56 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  23.53 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  27.78 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  24.38 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  25.98 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  26.15 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  24.77 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  22.46 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  25.51 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.77 
 
 		 662 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  28.01 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  24.72 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  24.72 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  25 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  24.72 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26 
 
 		 664 aa  59.3  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  24.72 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  27.46 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  26.15 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3069  ferric enterobactin transport system permease protein FepG  26.48 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.605614  normal  0.369476 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  35.65 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  24.4 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  26.73 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  28.26 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  24.83 
 
 		 685 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  24.68 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  24.5 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  24.04 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0513  iron ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132048  normal  0.109169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  26.43 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  27.08 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  24.48 
 
 		 685 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>