79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3174 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  99.46 
 
 
186 aa  383  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  90.32 
 
 
186 aa  327  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  90.32 
 
 
186 aa  327  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  89.25 
 
 
186 aa  327  9e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  89.78 
 
 
186 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  88.71 
 
 
186 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  70.97 
 
 
186 aa  291  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  68.82 
 
 
189 aa  286  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  67.93 
 
 
185 aa  285  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  72.58 
 
 
186 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  69.89 
 
 
185 aa  264  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  61.54 
 
 
185 aa  258  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  64.71 
 
 
187 aa  225  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  35.2 
 
 
174 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  33.91 
 
 
181 aa  99  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  30.32 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  35.14 
 
 
176 aa  93.6  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  30.94 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  32.12 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  27.78 
 
 
195 aa  88.2  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  33.33 
 
 
188 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  36.97 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  32.8 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  31.32 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  29.63 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  30.68 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  35.29 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  34.04 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  31.38 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  27.07 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  31.98 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  27.07 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  32.98 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  28.8 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  31.98 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  32.95 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  26.42 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  32.37 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  31.84 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  24.44 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  31.14 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  27.03 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  31.67 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  31.84 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  31.84 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  28.4 
 
 
191 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  24.46 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  22.47 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  24.58 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  26.49 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  28.96 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  30.32 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  25.71 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  30.69 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  30.81 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  24.24 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  31.18 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  28.11 
 
 
178 aa  52  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1765  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  51.2  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0125909  normal  0.0261997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4738  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  27.51 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  26.26 
 
 
173 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  22.7 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  25.62 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  25.93 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  29.07 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  27.57 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  24.19 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  25.45 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  25.71 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  24.69 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  24.86 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  35.59 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  35.59 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  24.6 
 
 
179 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>