More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3038 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  98.37 
 
 		 367 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  100 
 
 		 367 aa  748    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  98.64 
 
 		 367 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  83.38 
 
 		 367 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  98.37 
 
 		 367 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  83.38 
 
 		 367 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1372  response regulator receiver protein  83.11 
 
 		 367 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0119088  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2546  response regulator receiver protein  83.11 
 
 		 376 aa  633  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3196  response regulator  81.2 
 
 		 367 aa  623  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  68.94 
 
 		 367 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1648  response regulator receiver protein  66.49 
 
 		 367 aa  511  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0057956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2267  response regulator receiver protein  66.49 
 
 		 367 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0287525  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2806  response regulator receiver protein  60.65 
 
 		 373 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1396  response regulator receiver protein  61.85 
 
 		 367 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00425013  normal  0.314583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1356  response regulator receiver  58.75 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1391  response regulator receiver protein  58.86 
 
 		 368 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  30.74 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.37 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  30.74 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.74 
 
 		 412 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  30 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  30 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  29.78 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  32.22 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  29.41 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  28.89 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  30.53 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  28.9 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  29.39 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1082  response regulator  29.66 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  30.54 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1959  response regulator of RpoS  29.23 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  27.76 
 
 		 368 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1969  response regulator of RpoS  32.55 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.313928  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2331  response regulator of RpoS  32.55 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000591908  normal  0.501576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2078  response regulator of RpoS  32.55 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2710  response regulator of RpoS  28.23 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.317611  hitchhiker  0.000232648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2526  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.13 
 
 		 715 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.263284  normal  0.0502692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.92 
 
 		 602 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0532  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  35.62 
 
 		 715 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2201  response regulator of RpoS  29.06 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 544 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01211  response regulator of RpoS  30.19 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1720  response regulator of RpoS  30.19 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1384  response regulator of RpoS  30.19 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.421294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1343  response regulator of RpoS  30.19 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00109338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01221  hypothetical protein  30.19 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2392  response regulator of RpoS  30.19 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1906  response regulator of RpoS  30.19 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174648  normal  0.215745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.25 
 
 		 739 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  32.56 
 
 		 598 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1400  response regulator of RpoS  30.19 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2308  response regulator of RpoS  31.13 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.863566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1880  response regulator of RpoS  29.25 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.239117  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1943  response regulator of RpoS  29.25 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.941531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1575  response regulator of RpoS  29.25 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.307447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1392  response regulator of RpoS  29.25 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1479  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1886  response regulator of RpoS  29.25 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0489347  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2280  response regulator of RpoS  28.57 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.74 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 526 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 551 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3465  putative PAS/PAC sensor protein  37.07 
 
 		 489 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1979  response regulator of RpoS  27.09 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 361 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 		 513 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.32 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3744  putative GAF sensor protein  35.65 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2461  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.9 
 
 		 581 aa  86.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  30.32 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.63 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  37.25 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  39 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  37.38 
 
 		 122 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0183  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.25 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1091  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.81 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0470  sigma-54 dependent response regulator  37.5 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2160  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.65 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 653 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0833  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.96038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.64 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2942  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.2 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>