93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3034 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3034  S23 ribosomal protein  100 
 
 
119 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0797  hypothetical protein  56.25 
 
 
115 aa  127  8e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4127  hypothetical protein  54.95 
 
 
113 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1652  hypothetical protein  52.34 
 
 
125 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193408  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1383  hypothetical protein  51.38 
 
 
117 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2842  hypothetical protein  48.31 
 
 
125 aa  114  4e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.578199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2542  hypothetical protein  50.46 
 
 
117 aa  112  2e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3192  hypothetical protein  49.54 
 
 
117 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1316  hypothetical protein  50.46 
 
 
117 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0254819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2263  hypothetical protein  46.61 
 
 
128 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  decreased coverage  0.000429969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2821  hypothetical protein  48.18 
 
 
127 aa  105  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1864  S23 ribosomal protein  45.61 
 
 
123 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.508556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  46.85 
 
 
131 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2144  hypothetical protein  49.54 
 
 
121 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1770  hypothetical protein  49.12 
 
 
119 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00388506  normal  0.0836423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2787  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  1.22053e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1396  hypothetical protein  45.95 
 
 
119 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0925  S23 ribosomal protein  45.3 
 
 
118 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3035  S23 ribosomal  51.72 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.964559  hitchhiker  0.00587494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  42.37 
 
 
122 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1960  S23 ribosomal protein  42.37 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1949  S23 ribosomal protein  41.53 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.512605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1940  S23 ribosomal protein  41.53 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0249687  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1904  S23 ribosomal protein  41.59 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2609  S23 ribosomal protein  41.53 
 
 
122 aa  80.9  5e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.839204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0809  S23 ribosomal protein  39.47 
 
 
134 aa  79.3  1e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2891  hypothetical protein  36.44 
 
 
121 aa  79.7  1e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0159035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0667  S23 ribosomal protein  41.53 
 
 
119 aa  79.3  2e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0266  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  78.6  3e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3816  hypothetical protein  42.98 
 
 
123 aa  77.4  6e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  38.94 
 
 
127 aa  76.3  1e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0702  hypothetical protein  35.71 
 
 
130 aa  75.9  2e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.25706e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0863  S23 ribosomal protein  34.34 
 
 
104 aa  74.7  4e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1181  S23 ribosomal protein  39.09 
 
 
122 aa  73.9  7e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3995  hypothetical protein  44.05 
 
 
107 aa  73.6  8e-13  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4923  S23 ribosomal protein  35.65 
 
 
119 aa  72  2e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1495  S23 ribosomal protein  36.75 
 
 
124 aa  72  2e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0033  hypothetical protein  36.21 
 
 
116 aa  72.8  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3825  hypothetical protein  35.09 
 
 
118 aa  71.6  4e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.169171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1774  S23 ribosomal protein  37.72 
 
 
118 aa  70.9  6e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113241  normal  0.0178351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3829  S23 ribosomal protein  39.82 
 
 
123 aa  70.1  9e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0815906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  36.13 
 
 
143 aa  70.1  1e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3212  S23 ribosomal protein  35.14 
 
 
124 aa  70.1  1e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1780  hypothetical protein  38.71 
 
 
119 aa  69.7  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4428  glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.04 
 
 
583 aa  68.9  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2018  S23 ribosomal protein  37.07 
 
 
116 aa  67.4  6e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.575414  normal  0.264087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2569  S23 ribosomal protein  35.29 
 
 
115 aa  66.2  1e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0653  hypothetical protein  31.9 
 
 
128 aa  66.6  1e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4754  S23 ribosomal protein  33.33 
 
 
117 aa  65.5  2e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0834  S23 ribosomal protein  33.33 
 
 
122 aa  64.7  4e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.530691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2269  S23 ribosomal protein  44.87 
 
 
129 aa  64.3  5e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1776  S23 ribosomal protein  30.25 
 
 
118 aa  64.3  6e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.53039e-09  normal  0.0187612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0596  S23 ribosomal protein  30.51 
 
 
122 aa  62.4  2e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0419728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03005  hypothetical protein  34.23 
 
 
135 aa  62  3e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  30.36 
 
 
125 aa  62  3e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2639  S23 ribosomal protein  35.34 
 
 
117 aa  59.7  1e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1903  S23 ribosomal protein  31.86 
 
 
117 aa  60.1  1e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.452499  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0743  S23 ribosomal protein  30.7 
 
 
121 aa  59.7  1e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0610  S23 ribosomal protein  29.2 
 
 
124 aa  58.5  3e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28865e-18 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0782  S23 ribosomal protein  33.04 
 
 
142 aa  58.5  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.653003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2403  hypothetical protein  35.24 
 
 
108 aa  57.4  6e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.589367  hitchhiker  0.00347564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  30.97 
 
 
119 aa  57.4  7e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0716  hypothetical protein  31.68 
 
 
120 aa  56.2  1e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0769  hypothetical protein  31.68 
 
 
120 aa  56.2  1e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  26.09 
 
 
127 aa  55.5  2e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3082  hypothetical protein  36.96 
 
 
119 aa  55.8  2e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0352  hypothetical protein  29.2 
 
 
133 aa  54.7  4e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50367  normal  0.137183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1843  S23 ribosomal protein  37.21 
 
 
116 aa  53.9  8e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.561977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3674  S23 ribosomal protein  29.46 
 
 
119 aa  53.1  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  35.29 
 
 
119 aa  53.1  1e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4133  hypothetical protein  28.32 
 
 
133 aa  51.2  5e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.130152  hitchhiker  0.00757123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3073  hypothetical protein  29.46 
 
 
166 aa  49.3  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00271556  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1934  S23 ribosomal protein  44.29 
 
 
85 aa  49.3  2e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285916  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0039  S23 ribosomal  31.62 
 
 
121 aa  48.5  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.746441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1658  hypothetical protein  28.32 
 
 
133 aa  48.1  4e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694544  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1611  hypothetical protein  28.83 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0528255  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  32.98 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  32.98 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  32.98 
 
 
117 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  32.98 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2021  hypothetical protein  32.98 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.933908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  32.98 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  32.98 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3459  S23 ribosomal protein  29.41 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  32.98 
 
 
117 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1793  hypothetical protein  28.45 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0984  S23 ribosomal  32 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302642  normal  0.219777 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  31.58 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>