54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3015 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  100 
 
 
149 aa  302  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  100 
 
 
148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  98.66 
 
 
149 aa  298  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  93.96 
 
 
149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  71.81 
 
 
148 aa  216  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  60.81 
 
 
150 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  59.06 
 
 
168 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  58.39 
 
 
170 aa  183  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  58.39 
 
 
168 aa  183  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  46.54 
 
 
202 aa  137  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3986  copper resistance lipoprotein NlpE  47.47 
 
 
158 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.773846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  43.97 
 
 
172 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.24 
 
 
278 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  43.45 
 
 
169 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  36.52 
 
 
178 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  38.92 
 
 
169 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  44.25 
 
 
163 aa  97.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  41.6 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  41.6 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  36.97 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2757  hypothetical protein  31.16 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  28.38 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  32.17 
 
 
402 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  35.71 
 
 
236 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.71 
 
 
236 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.451187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.71 
 
 
236 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.71 
 
 
236 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.71 
 
 
236 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.71 
 
 
236 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.71 
 
 
236 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  35.71 
 
 
236 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  36.17 
 
 
233 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  36.17 
 
 
233 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  34.69 
 
 
236 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  36.17 
 
 
233 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  36.17 
 
 
233 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  36.17 
 
 
233 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1474  hypothetical protein  32.61 
 
 
241 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0773406  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  31.97 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  34.02 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  34.74 
 
 
227 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  34.74 
 
 
227 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1524  hypothetical protein  34.02 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  34.74 
 
 
227 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  30.91 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  37.89 
 
 
232 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.56 
 
 
232 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  40.21 
 
 
227 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  28.89 
 
 
401 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4206  hypothetical protein  33 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.72 
 
 
365 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  55.17 
 
 
229 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27 
 
 
354 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0033  hypothetical protein  27.85 
 
 
207 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>