87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2991 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  83.24 
 
 
700 aa  1171    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  85.16 
 
 
696 aa  1258    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  56.67 
 
 
680 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  99.86 
 
 
701 aa  1440    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  55.4 
 
 
657 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  98.29 
 
 
698 aa  1292    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  100 
 
 
701 aa  1442    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  84.45 
 
 
696 aa  1247    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  50.83 
 
 
677 aa  676    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  99.57 
 
 
701 aa  1435    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  43.28 
 
 
642 aa  515  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.2  hypothetical protein  79.53 
 
 
310 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  42.5 
 
 
655 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  38.95 
 
 
687 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  38.24 
 
 
612 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.3  hypothetical protein  83.13 
 
 
122 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140.1  hypothetical protein  80 
 
 
135 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.71 
 
 
778 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  21.84 
 
 
729 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  23.66 
 
 
789 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  31.11 
 
 
843 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  23.85 
 
 
639 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  29.08 
 
 
640 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  30.73 
 
 
639 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  27.04 
 
 
639 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  27.23 
 
 
639 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  30.48 
 
 
762 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  27.04 
 
 
639 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.32 
 
 
639 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  28.27 
 
 
639 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  30.77 
 
 
822 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  30.15 
 
 
788 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  23.34 
 
 
639 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  26.64 
 
 
885 aa  58.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  30.85 
 
 
762 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  26.07 
 
 
650 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  30.85 
 
 
762 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.73 
 
 
650 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  22.77 
 
 
639 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  34.09 
 
 
758 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  30.32 
 
 
788 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25.97 
 
 
650 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  28.19 
 
 
833 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  30.77 
 
 
789 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  29.38 
 
 
724 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  30.32 
 
 
646 aa  55.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  24.66 
 
 
730 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  28.95 
 
 
754 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  24.66 
 
 
730 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  29.41 
 
 
639 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  39.51 
 
 
936 aa  54.7  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  25.08 
 
 
663 aa  54.3  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  24.66 
 
 
730 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  25.32 
 
 
650 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  22.05 
 
 
731 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  25.32 
 
 
650 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  26.78 
 
 
731 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  63.41 
 
 
764 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  26.34 
 
 
660 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.92 
 
 
745 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  29.47 
 
 
716 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  34.34 
 
 
770 aa  51.6  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  25.23 
 
 
714 aa  51.2  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  28.04 
 
 
761 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  33.91 
 
 
945 aa  51.2  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  28.04 
 
 
764 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  28.04 
 
 
761 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  28.04 
 
 
764 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.28 
 
 
650 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  31.01 
 
 
765 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  28.11 
 
 
735 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  25.99 
 
 
741 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  23.23 
 
 
745 aa  48.5  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  24.48 
 
 
820 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.78 
 
 
653 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  28.65 
 
 
738 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  33.33 
 
 
766 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  25 
 
 
757 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  28.72 
 
 
1053 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  26.4 
 
 
719 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  31.65 
 
 
895 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  58.82 
 
 
863 aa  44.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  24.73 
 
 
727 aa  44.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  35.21 
 
 
729 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01691  putative serine rich repeat containing protein  54.76 
 
 
692 aa  44.3  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  25.14 
 
 
725 aa  44.3  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  24.07 
 
 
826 aa  44.3  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>