274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2927 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  54.76 
 
 
225 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  37.44 
 
 
224 aa  144  7e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.9 
 
 
215 aa  140  2e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  1.54774e-08 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  40.87 
 
 
216 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  40.87 
 
 
216 aa  138  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  39.42 
 
 
216 aa  134  1e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  6.07321e-13 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  34.42 
 
 
230 aa  127  1e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  37.88 
 
 
220 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.3506e-09  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  33.49 
 
 
216 aa  118  8e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  34.51 
 
 
240 aa  112  4e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  34.51 
 
 
240 aa  112  4e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  34.51 
 
 
240 aa  112  4e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  33.18 
 
 
221 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  34.22 
 
 
222 aa  108  7e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.86349e-08 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  37.5 
 
 
236 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.24176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
229 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  34.76 
 
 
221 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  34.76 
 
 
221 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  32.24 
 
 
221 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  33.65 
 
 
216 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 
229 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31.73 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  33.18 
 
 
218 aa  91.7  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  39.2 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  1.25637e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  30.39 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.27 
 
 
235 aa  89.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.97465e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  32.43 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  32.58 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  32.48 
 
 
243 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  34.27 
 
 
231 aa  83.6  2e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  32.37 
 
 
237 aa  83.2  3e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
228 aa  80.9  1e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  28.31 
 
 
240 aa  79  4e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  29.69 
 
 
251 aa  75.5  5e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  29.27 
 
 
213 aa  75.5  6e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  26.98 
 
 
234 aa  70.5  2e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  37.1 
 
 
133 aa  68.2  8e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  46.34 
 
 
126 aa  66.2  3e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  30.6 
 
 
219 aa  65.5  5e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 
224 aa  65.1  6e-10  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  27.51 
 
 
238 aa  65.1  7e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  27.51 
 
 
216 aa  65.1  8e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  5.55461e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  27.48 
 
 
222 aa  64.7  9e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  25.71 
 
 
227 aa  64.3  1e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 
196 aa  63.9  2e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  32.14 
 
 
229 aa  63.2  3e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  32.17 
 
 
215 aa  63.2  3e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  27.36 
 
 
219 aa  62.4  4e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 
227 aa  60.5  2e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  29.41 
 
 
245 aa  60.1  2e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  26.21 
 
 
216 aa  59.7  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  29.15 
 
 
210 aa  59.3  4e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  40.3 
 
 
232 aa  58.5  6e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.08036e-07  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  25.42 
 
 
215 aa  58.5  7e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  26.06 
 
 
210 aa  57.4  1e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  25.87 
 
 
230 aa  57.8  1e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.71 
 
 
217 aa  56.2  4e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.71 
 
 
217 aa  56.2  4e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  25.71 
 
 
217 aa  56.2  4e-07  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  26.49 
 
 
235 aa  55.1  7e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  32.69 
 
 
244 aa  55.1  7e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  27.59 
 
 
234 aa  55.1  7e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  45.9 
 
 
71 aa  54.7  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  2.89495e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.88 
 
 
201 aa  53.9  1e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  36.59 
 
 
202 aa  53.9  1e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  27.4 
 
 
204 aa  53.5  2e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25 
 
 
264 aa  53.1  3e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.39 
 
 
233 aa  53.1  3e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  29.91 
 
 
220 aa  53.1  3e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  23.73 
 
 
270 aa  52.4  4e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  6.04594e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.96 
 
 
233 aa  52.4  4e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  36.52 
 
 
209 aa  52.4  5e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  37.84 
 
 
120 aa  52.4  5e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32 
 
 
200 aa  52  6e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25 
 
 
264 aa  52  6e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.52 
 
 
233 aa  52  6e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  24.23 
 
 
209 aa  50.8  1e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  30.56 
 
 
149 aa  51.2  1e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  26.98 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.64 
 
 
214 aa  51.2  1e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  43.33 
 
 
229 aa  51.2  1e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.53974e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 
136 aa  51.2  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2121  RulA protein, putative  30.08 
 
 
147 aa  50.8  1e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  26.9 
 
 
228 aa  50.8  2e-05  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  2.74718e-08  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1916  peptidase S24, S26A and S26B  28.57 
 
 
147 aa  50.4  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  37.38 
 
 
211 aa  50.1  2e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.85 
 
 
204 aa  50.4  2e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.00121e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.57 
 
 
196 aa  50.1  2e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  26.87 
 
 
210 aa  50.4  2e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  26.87 
 
 
210 aa  50.4  2e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 
212 aa  50.1  2e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  31.73 
 
 
244 aa  50.1  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  30.77 
 
 
237 aa  49.7  3e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  24.12 
 
 
212 aa  49.7  3e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  26.37 
 
 
220 aa  49.7  3e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  30.77 
 
 
237 aa  49.7  3e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.32202e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  35.54 
 
 
206 aa  49.3  4e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  28.97 
 
 
214 aa  49.3  4e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>