61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2903 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  100 
 
 
453 aa  925    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  23.95 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  31.55 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  24.25 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  23.78 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  23.94 
 
 
608 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  38.32 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  34.92 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  39.52 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  38.46 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  38.05 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  22.11 
 
 
610 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  34.46 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  25.29 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  35.77 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  34.51 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  39.05 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  31.34 
 
 
464 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  36.7 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  38.61 
 
 
577 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  60 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  32.47 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  58 
 
 
709 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  44.12 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  28.48 
 
 
736 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  30.53 
 
 
454 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  33.93 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  62.79 
 
 
445 aa  64.3  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  35.42 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  23.19 
 
 
478 aa  63.9  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  35.48 
 
 
422 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  31.54 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  44.23 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  49.02 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  50.98 
 
 
769 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  36.26 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  54.35 
 
 
418 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  32.26 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.1 
 
 
429 aa  53.5  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  47.83 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  32.56 
 
 
680 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  47.83 
 
 
353 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  47.37 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  29.01 
 
 
369 aa  51.2  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  23 
 
 
369 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  46.15 
 
 
606 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  27.87 
 
 
582 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  33.33 
 
 
708 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  35.09 
 
 
457 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  37.21 
 
 
573 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3136  hypothetical protein  33.33 
 
 
648 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  47.73 
 
 
423 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  34.33 
 
 
712 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  28.81 
 
 
533 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1205  ABC transporter related  25.42 
 
 
275 aa  43.5  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00183606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  28.3 
 
 
540 aa  43.5  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  38.89 
 
 
562 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  32.79 
 
 
251 aa  43.5  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  42.86 
 
 
399 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.08 
 
 
666 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  37.93 
 
 
619 aa  43.5  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>