78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2781 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2781  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
407 aa  815    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.689609  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3251  sodium/glutamate symporter  75.86 
 
 
407 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0118  sodium/glutamate symporter  78.08 
 
 
407 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  78.57 
 
 
407 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4777  sodium/glutamate symporter  77.83 
 
 
407 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2923  sodium/glutamate symporter  90.89 
 
 
407 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2705  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
407 aa  815    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4778  sodium/glutamate symporter  78.57 
 
 
407 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1482  sodium/glutamate symporter  91.38 
 
 
407 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.485218  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1547  sodium/glutamate symporter  91.63 
 
 
407 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2389  sodium/glutamate symporter  93.35 
 
 
407 aa  766    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.657227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1541  sodium/glutamate symporter  91.63 
 
 
407 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  76.85 
 
 
407 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2684  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
407 aa  815    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1682  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
407 aa  815    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00781316  normal  0.0287357 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  70.2 
 
 
407 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  70.2 
 
 
407 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  66.18 
 
 
408 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  65.69 
 
 
417 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07017  hypothetical protein  67.07 
 
 
420 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0092  sodium/glutamate symporter  67.08 
 
 
408 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000111115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000968  sodium/glutamate symporter  69.38 
 
 
361 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2697  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
407 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  46.21 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000567531  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  44.36 
 
 
424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  43.81 
 
 
424 aa  320  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2020  sodium/glutamate symporter  45.19 
 
 
412 aa  320  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.733127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  47.41 
 
 
404 aa  318  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  47.41 
 
 
404 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  47.41 
 
 
404 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  44.2 
 
 
409 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4228  sodium/glutamate symporter  50.13 
 
 
401 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0724268  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  42.53 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0996  sodium/glutamate symporter  50 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3988  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  41.75 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4157  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3864  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5026  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0058  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4104  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0052  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03463  hypothetical protein  47.7 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03511  glutamate transporter  47.7 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4872  sodium/glutamate symporter  49.07 
 
 
403 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854487  normal  0.0119787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1033  sodium/glutamate symporter  50 
 
 
401 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0995  sodium/glutamate symporter  47.66 
 
 
401 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3953  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4132  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0214352  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4026  sodium/glutamate symporter  47.7 
 
 
401 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4072  sodium/glutamate symporter  47.45 
 
 
401 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3963  sodium/glutamate symporter  47.45 
 
 
401 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  44.09 
 
 
404 aa  289  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  44.09 
 
 
404 aa  289  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4718  sodium/glutamate symporter  41.56 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0916  sodium/glutamate symport carrier protein  44.5 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.920005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  37.44 
 
 
409 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2643  sodium/glutamate symporter  40.49 
 
 
402 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0496  sodium/glutamate symporter  38.17 
 
 
392 aa  258  9e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  38.52 
 
 
400 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1355  sodium-glutamate symporter  37.2 
 
 
409 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  37.16 
 
 
402 aa  248  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0361  transporter, putative  33.94 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000537763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1451  sodium/glutamate symporter  35.75 
 
 
414 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  39.26 
 
 
402 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  39.26 
 
 
402 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2504  sodium/glutamate symporter  34.23 
 
 
398 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1050  sodium/glutamate symporter  36.29 
 
 
398 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0733546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0831  sodium/glutamate symporter  36.48 
 
 
402 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4118  hypothetical protein  34.83 
 
 
401 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.601595  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  33.91 
 
 
414 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4810  sodium/glutamate symporter  35.16 
 
 
399 aa  209  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1261  sodium/glutamate symporter  34.83 
 
 
402 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3454  sodium/glutamate symporter  35.21 
 
 
401 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890755  normal  0.830149 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0244  sodium/glutamate symporter  31.46 
 
 
392 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1953  sodium/glutamate symporter  35.36 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00992782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23160  sodium/glutamate symporter  34.83 
 
 
404 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000099413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  27.15 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>