More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2777 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  98.03 
 
 
305 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  98.68 
 
 
305 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  98.03 
 
 
305 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  87.46 
 
 
304 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  86.14 
 
 
303 aa  550  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  86.47 
 
 
303 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  85.81 
 
 
303 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  84.77 
 
 
303 aa  540  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  71.85 
 
 
302 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  69.33 
 
 
302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  68.67 
 
 
303 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  66.56 
 
 
302 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  69.33 
 
 
305 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  73.2 
 
 
305 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  64.92 
 
 
308 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  59.11 
 
 
319 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  58.15 
 
 
319 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  59.74 
 
 
319 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  56.63 
 
 
310 aa  361  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  48.85 
 
 
320 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  48.17 
 
 
310 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  49.13 
 
 
310 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  48.14 
 
 
320 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  49.16 
 
 
321 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  49.65 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  50.53 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  47.92 
 
 
318 aa  272  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  48.94 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  48.59 
 
 
318 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  43.21 
 
 
314 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  48.26 
 
 
313 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  48.24 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  48.1 
 
 
321 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  46.62 
 
 
308 aa  255  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  42.71 
 
 
299 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  40.88 
 
 
309 aa  225  7e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  41.46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  38.31 
 
 
320 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  32.82 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  32.42 
 
 
338 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  31.75 
 
 
353 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  34.83 
 
 
335 aa  112  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  33.45 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  33.45 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  32.73 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  33.45 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  34.18 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  32.96 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  33.82 
 
 
380 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  32.28 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  30.95 
 
 
392 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  32.6 
 
 
350 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  33.21 
 
 
335 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  32.29 
 
 
338 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  32.5 
 
 
335 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  32.56 
 
 
384 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  33.21 
 
 
363 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  35.5 
 
 
396 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  33.21 
 
 
338 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  42.95 
 
 
400 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.37 
 
 
807 aa  102  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  31.82 
 
 
396 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  42.28 
 
 
404 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  33.78 
 
 
393 aa  99.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  41.61 
 
 
404 aa  99.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  41.61 
 
 
400 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  40.94 
 
 
404 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  40.94 
 
 
404 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  40.94 
 
 
404 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  40.94 
 
 
404 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  40.94 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  28.72 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  30.3 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  30.3 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  42.45 
 
 
400 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  43.17 
 
 
397 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  30.3 
 
 
367 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  30.3 
 
 
391 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  40.97 
 
 
400 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  30.3 
 
 
367 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  29.96 
 
 
560 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  30.77 
 
 
335 aa  96.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  30.3 
 
 
396 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  40.94 
 
 
423 aa  96.3  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.26 
 
 
776 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  40.94 
 
 
422 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  30.3 
 
 
396 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  40.94 
 
 
425 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  40.94 
 
 
425 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  40.94 
 
 
425 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  40.94 
 
 
425 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  40.94 
 
 
425 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  40.94 
 
 
425 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.26 
 
 
768 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  42.42 
 
 
397 aa  95.9  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  33.17 
 
 
403 aa  95.5  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  30.3 
 
 
396 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>