More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2767 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 924 aa  1892    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 924 aa  1892    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 924 aa  1892    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 883 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 883 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 883 aa  445  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.79 
 
 		 884 aa  432  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 891 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 872 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  30.75 
 
 		 895 aa  356  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 890 aa  354  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 890 aa  353  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 875 aa  343  8e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 890 aa  341  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 935 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 935 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 935 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  30.38 
 
 		 893 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  30.26 
 
 		 899 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 896 aa  334  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 886 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 930 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 930 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 930 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 882 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 886 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 869 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 882 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  29.37 
 
 		 827 aa  317  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.23 
 
 		 936 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 855 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 852 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 861 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 966 aa  301  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 861 aa  300  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 861 aa  300  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 871 aa  300  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 933 aa  297  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 861 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 861 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 861 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 909 aa  293  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 909 aa  293  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 800 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 892 aa  292  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 937 aa  292  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 857 aa  291  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 849 aa  291  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 894 aa  290  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 938 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 841 aa  289  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 847 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.01 
 
 		 866 aa  283  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 974 aa  281  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 853 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 853 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 869 aa  281  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 853 aa  280  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 843 aa  280  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  28.41 
 
 		 922 aa  279  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 912 aa  279  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 935 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 853 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 873 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 896 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 873 aa  274  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 901 aa  273  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 867 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 924 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 879 aa  271  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 836 aa  270  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 966 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 867 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 867 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.21 
 
 		 853 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 838 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 855 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 867 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 925 aa  265  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  28.72 
 
 		 839 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 842 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 957 aa  262  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 948 aa  260  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 874 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 975 aa  259  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  26.55 
 
 		 966 aa  258  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 904 aa  255  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  27.97 
 
 		 877 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 855 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 944 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 987 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  28.9 
 
 		 709 aa  250  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 866 aa  250  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  26.39 
 
 		 834 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 951 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 944 aa  248  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 910 aa  247  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 952 aa  247  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 947 aa  239  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.2 
 
 		 880 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>